Entry information : SiAPx01 (Si037167m)
| Entry ID | 1993 |
|---|---|
| Creation | 2008-06-25 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-07-03 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2011-12-15 (Qiang Li) |
Peroxidase information: SiAPx01 (Si037167m)
| Name (synonym) | SiAPx01 (Si037167m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Setaria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Setaria italica [TaxId: 4555 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | Seedlings |
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| Inducer | Drought |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '1993' 'complement(join(49453628..49453643,49453721..49453779,49453851..49453953,49454081..49454160,49454244..49454329,49454485..49454533,49455609..49455674,49455775..49455949,49456069..49456187))' |
Exons►
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Literature and cross-references SiAPx01 (Si037167m)
| Literature | Zhang,J.P., Liu,T.S., Fu,J.J., Zhu,Y., Jia,J.J., Zheng,J., Zhao,Y., Zhang,Y. and Wang,G.Y. Construction and application of EST library from Setaria italica in response to dehydration stress. Genomics 90 (1), 121-131 (2007). |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_9 (49456187..49453628) |
| EST ref. | GenBank: EC612205 [Fragment] |
Protein sequence: SiAPx01 (Si037167m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic and 1 EST. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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