Entry information : CsAPx05
Entry ID | 3426 |
---|---|
Creation | 2006-07-28 (Felipe Teixeira) |
Last sequence changes | 2012-01-04 (Felipe Teixeira) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Qiang Li |
Last annotation changes | 2012-01-05 (Qiang Li) |
Peroxidase information: CsAPx05
Name | CsAPx05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Citrus sinensis [TaxId: 2711 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | Thylakoid-bound |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3426' 'join(442901..442972,443036..443068,443160..443294,443549..443669,443742..443842,443927..444014,444953..445020,445103..445189,445354..445428,445531..445608,445689..445793,446296..446361,446666..446818)' |
Exons►
|
Literature and cross-references CsAPx05
Literature | Uratsu,S.L., Fisk,H.J. and Dandekar,A.M. Analysis of peel specific genes in Citrus. Unpublished (2003). |
---|---|
DNA ref. | Phytozome 12: scaffold00004 (442901..446818) |
Cluster/Prediction ref. | UniGene: Csi.4511 |
Protein sequence: CsAPx05
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Probably produced by alternative splicing (CsAPx05 Stromal form). Complete sequence from genomic and 17 ESTs. No prediction from phytozome. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|