Entry information : PtroMPO
Entry ID | 4034 |
---|---|
Creation | 2007-01-24 (Marcel Zamocky) |
Last sequence changes | 2010-12-21 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Myriam Duval |
Last annotation changes | 2010-12-21 (Myriam Duval) |
Peroxidase information: PtroMPO
Name | PtroMPO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Myeloperoxidase [Orthogroup: MPO001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Pan troglodytes (chimpanzee) [TaxId: 9598 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '4034' 'complement(join(57444538..57444745,57445537..57445774,57446630..57446800,57447296..57447551,57449419..57449579,57451707..57452025,57452888..57453094,57453177..57453306,57453404..57453527,57453720..57453895,57454247..57454340,57454486..57454639))' |
Exons►
|
Literature and cross-references PtroMPO
Literature | Zamocky M. et al. (2007) Phylogenetic relationship in the peroxidase-cyclooxygenase superfamily.
|
---|---|
DNA ref. | GenBank: NC_006484.2 (57454639..57444538) |
mRNA ref. | GenBank: XM_001162602.1 [Incorrect prediction] |
Protein sequence: PtroMPO
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 17, 13 introns). No EST. Isolate="Yerkes chimp pedigree #C0471 (Clint)". | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|