Entry information : VvAPx01 (GSVIVT01025104001 / Vitvi12X-PACid_17833160)
Entry ID | 5169 |
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Creation | 2009-02-27 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2009-02-27 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2015-07-29 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: VvAPx01 (GSVIVT01025104001 / Vitvi12X-PACid_17833160)
Name (synonym) | VvAPx01 (GSVIVT01025104001 / Vitvi12X-PACid_17833160) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Vitaceae Vitis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Vitis vinifera (Grape) [TaxId: 29760 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | Cytosolic |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5169' 'complement(join(4441617..4441632,4441752..4441810,4441921..4442023,4442146..4442225,4442354..4442439,4442561..4442609,4444090..4444155,4445962..4446136,4446242..4446360))' |
Exons►
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Literature and cross-references VvAPx01 (GSVIVT01025104001 / Vitvi12X-PACid_17833160)
Literature | Velasco,R., et al., The first genome sequence of an elite grapevine cultivar (Pinot noir Vitis vinifera L.): coping with a highly heterozygous genome |
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DNA ref. | Phytozome 12: chr6 (4446360..4441617) |
Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vvi.22187 Vvi.8087 |
Protein sequence: VvAPx01 (GSVIVT01025104001 / Vitvi12X-PACid_17833160)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 6, 7 introns) and 226 ESTs (2 unigenes). Cultivar="Pinot Noir" and "PN40024". Also found in AM469600 (Contig end). | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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