Entry information : MdAPx-R
| Entry ID | 5191 |
|---|---|
| Creation | 2007-04-13 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-05-03 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Catherine Mathe |
| Last annotation changes | 2011-07-28 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: MdAPx-R
| Name | MdAPx-R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase related [Orthogroup: APx-R001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rosaceae Malus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Malus domestica (apple tree) [TaxId: 3750 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | Leaves |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5191' 'join(7945..8113,8212..8314,8393..8520,8811..8881,9042..9084,9167..9263,9497..9580,9809..9924,10377..10434,10949..11051)' |
Exons►
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Literature and cross-references MdAPx-R
| Literature | Korban,S., Vodkin,L., Liu,L., Gasic,K., Gonzales,O., Hernandez,A., Aldwinckle,H., Malnoy,M., Carroll,N., Goldsbrough,P., Orvis,K., Clifton,S., Pape,D., Marra,M., Hillier,L., Martin,J., Wylie,T., Dante,M., Theising,B., Bowers,Y., Gibbons,M., Ritter,E., Ronko,I.,Tsagareishvili,R., Kennedy,S., Waterston,R. and Wilson,R. Apple Functional Genomics grant - NSF 0321702 |
|---|---|
| DNA ref. | GenBank: ACYM01051383.1 (7945..11051) |
| EST ref. | GenBank: CX025415 [Fragment] |
Protein sequence: MdAPx-R
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from 2 ESTs (CX025415 and CN490022) and genomic (9 introns). Cultivar="GoldRush". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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