Entry information : VvAPx-R (GSVIVT01035858001)
| Entry ID | 5173 |
|---|---|
| Creation | 2009-02-27 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-07-28 (Catherine Mathe) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2012-01-05 (Qiang LI) |
Peroxidase information: VvAPx-R (GSVIVT01035858001)
| Name (synonym) | VvAPx-R (GSVIVT01035858001) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase related [Orthogroup: APx-R001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Vitaceae Vitis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Vitis vinifera (Grape) [TaxId: 29760 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue types | Berries Leaves Petioles |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducers | Bacterium infection Pathogen interaction |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5173' 'complement(join(4942548..4942650,4943271..4943337,4943714..4943835,4946577..4946660,4946935..4947031,4947125..4947167,4947354..4947424,4948640..4948767,4949347..4949461,4950314..4950476))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references VvAPx-R (GSVIVT01035858001)
| Literature | REFERENCE 1 Goes da Silva,F., Lim,H., Iandolino,A., Baek,J., Leslie,A., Xu,J., Jones,K., Walker,M.A. and Cook,D.R. Transcriptional responses of Vitis vinifera to infection by the bacterial pathogen Xylella fastidiosa.
REFERENCE 2 Velasco,R., et al.,The first genome sequence of an elite grapevine cultivar (Pinot noir Vitis vinifera L.): coping with a highly heterozygous genome |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: chr4 (4950476..4942548) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vvi.7193 |
Protein sequence: VvAPx-R (GSVIVT01035858001)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 19, 9 introns) and 7 ESTs. Cultivar="Cabernet Sauvignon", "PN40024" and "Pinot Noir". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
