Entry information : SbGPx05 (Sobic.006G272900.2 [2.1] / Sb06g033440 [1.4])
| Entry ID | 5736 |
|---|---|
| Creation | 2007-08-16 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-01-18 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Messaoudi |
| Last annotation changes | 2014-08-06 (Messaoudi) |
Peroxidase information: SbGPx05 (Sobic.006G272900.2 [2.1] / Sb06g033440 [1.4])
| Name (synonym) | SbGPx05 (Sobic.006G272900.2 [2.1] / Sb06g033440 [1.4]) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Plant glutathione peroxidase [Orthogroup: Gpx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Sorghum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Sorghum bicolor [TaxId: 4558 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | Pollens |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5736' 'join(1807243..1807398,1808411..1808487,1809139..1809200,1814700..1814818,1822295..1822462,1822535..1822570)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references SbGPx05 (Sobic.006G272900.2 [2.1] / Sb06g033440 [1.4])
| Literature | Cordonnier-Pratt,M.-M., Suzuki,Y., Sugano,S., Klein,R.R., Liang,C.,
Sun,F., Sullivan,R., Eastman,A., Cannon,R., Kern,B., Morgan,J., Lucas,A., Al-Sheikh,A., Jones,V., Adibi,N., Owen,A., Gao,J. and Pratt,L.H. EST database from Sorghum: pollen. |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: super_10 (1807243..1822570) |
| EST ref. | GenBank: CF481077 |
Protein sequence: SbGPx05 (Sobic.006G272900.2 [2.1] / Sb06g033440 [1.4])
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from 2 ESTs. Cultivar="BTx623". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
