Entry information : PtGPx[P]01 (POPTR_0018s02710)
| Entry ID | 5739 |
|---|---|
| Creation | 2007-08-16 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-08-02 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | theoretical translation / pseudogene |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2012-03-08 (Qiang Li) |
Peroxidase information: PtGPx[P]01 (POPTR_0018s02710)
| Name (synonym) | PtGPx[P]01 (POPTR_0018s02710) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Plant glutathione peroxidase [Orthogroup: Gpx2001]* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Salicaceae Populus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Populus trichocarpa (Western balsam poplar) [TaxId: 3694 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5739' 'join(2426439..2426687,2427187..2427273,2427609..2427674,2428338..2428457,2428539..2428739)' |
Exons►
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Literature and cross-references PtGPx[P]01 (POPTR_0018s02710)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_18 (2426439..2428739) |
|---|
Protein sequence: PtGPx[P]01 (POPTR_0018s02710)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 18, 4 introns). No EST. Last exon is missing (after FQI) => pseudogen. Incorrect prediction from Phytozome. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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