Entry information : PplLDS01-1 ( PplLDS01a)
| Entry ID | 6654 |
|---|---|
| Creation | 2009-03-29 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-06 (Catherine Mathe (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2016-02-11 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PplLDS01-1 ( PplLDS01a)
| Name (synonym) | PplLDS01-1 ( PplLDS01a) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Coriolaceae Postia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Postia placenta [TaxId: 104341 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | Alkaline treatment |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6654' 'join(1..177,242..304,363..447,506..778,852..1007,1066..1175,1235..1453,1518..1682,1745..1827,1891..1925,1979..2112,2174..2207,2259..2302,2358..2405,2457..2595,2651..2976,3029..3208,3259..3344,3398..3518,3570..3855,3916..3920,3972..4015,4072..4099,4149..4228,4278..4368,4427..4438)' |
Exons►
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Literature and cross-references PplLDS01-1 ( PplLDS01a)
| Literature | Lucas,S., Rokhsar,D., Wang,M., Lindquist,E.A., Challacombe,J., Grigoriev,I., Brettin,T. and Cullen,D. DOE Joint Genome Institute Postia placenta EST project |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_130 (159655..155218) |
| EST ref. | GenBank: FL618119.1 FL621887.1 [3' end] |
Protein sequence: PplLDS01-1 ( PplLDS01a)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (23 introns) and 12 ESTs. Also found in scaffold_37 (22368..26751). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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