Entry information : PcKat02
| Entry ID | 6716 |
|---|---|
| Creation | 2009-04-29 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2009-04-29 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Catherine Mathe |
| Last annotation changes | 2015-12-11 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: PcKat02
| Name | PcKat02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase [Orthogroup: Kat003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6716' 'join(2191467..2191668,2191726..2191798,2191852..2191908,2192002..2192078,2192132..2192204,2192253..2192293,2192342..2192394,2192445..2192485,2192537..2192659,2192709..2192769,2192826..2193004,2193058..2193126,2193193..2193299,2193358..2193392,2193446..2193479,2193533..2193660,2193712..2193815,2193870..2194077)' |
Exons►
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Literature and cross-references PcKat02
| Literature | Martinez,D., Larrondo,L.F., Putnam,N., Gelpke,M.D., Huang,K., Chapman,J., Helfenbein,K.G., Ramaiya,P., Detter,J.C., Larimer,F., Coutinho,P.M., Henrissat,B., Berka,R., Cullen,D. and Rokhsar,D. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nat. Biotechnol. 22 (6), 695-700 (2004). |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_4 (2191467..2194077) |
| mRNA ref. | JGI transcript: 128306 |
Protein sequence: PcKat02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (18 introns). No EST. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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