Entry information : PplKat02
| Entry ID | 6720 |
|---|---|
| Creation | 2009-04-29 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2016-02-11 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Achraf Jemmat |
| Last annotation changes | 2016-02-11 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: PplKat02
| Name | PplKat02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Catalase [Orthogroup: Kat003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Coriolaceae Postia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Postia placenta [TaxId: 104341 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6720' 'join(117966..118242,118296..118388,118444..118504,118565..118580,118633..118657,118709..118781,118847..118887,118935..118987,119040..119080,119132..119254,119314..119374,119436..119475,119534..119648,119702..119725,119775..119840,119893..119999,120056..120090,120210..120234,120286..120416,120475..120578,120644..120848)' |
Exons►
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Literature and cross-references PplKat02
| Literature | Martinez,D. et al., Genome, transcriptome, and secretome analysis of wood decay fungus Postia placenta supports unique mechanisms of lignocellulose conversion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (6), 1954-1959 (2009) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_152 (117966..120848) |
| EST ref. | GenBank: FL607519.1 [5' end] FL607518.1 [3' end] |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 112311 |
Protein sequence: PplKat02
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (20 introns) and 2 ESTs. Strain="Mad-698-R" |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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