Entry information : PplCIIBA
| Entry ID | 6737 |
|---|---|
| Creation | 2009-05-25 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-11 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2015-04-30 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PplCIIBA
| Name | PplCIIBA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Other class II peroxidase type A [Orthogroup: CIIBA001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Coriolaceae Postia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Postia placenta [TaxId: 104341 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6737' 'complement(join(1049946..1049996,1050057..1050223,1050292..1050436,1050494..1050788,1050863..1050941,1050997..1051038,1051089..1051102,1051157..1051261,1051323..1051387))' |
Exons►
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Literature and cross-references PplCIIBA
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_1 (1051387..1049946) |
|---|---|
| mRNA ref. | JGI transcript: 50226 [3' end] |
Protein sequence: PplCIIBA
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (7 introns). No EST. Incorrect prediction from JGI. Prob of splicing prediction of the PS when compared with orther orthologs. Also detected in scafold_58 (mismatchs but gene identity between the 2 scaffolds). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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