Entry information : LminPrx10(Lemmin2g0035810.t1)
Entry ID 18808
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx10(Lemmin2g0035810.t1)
Name LminPrx10(Lemmin2g0035810.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx10
start..stop
S start..stop
LminPrx36 657 0 1..333 1..333
LminPrx103 625 0 1..333 1..333
LminPrx85 625 0 1..333 1..333
LminPrx104 623 0 1..333 1..333
Literature and cross-references LminPrx10(Lemmin2g0035810.t1)
Protein sequence: LminPrx10(Lemmin2g0035810.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (311)
PWM (Da):   %s   36195.69 (34060.6)  
PI (pH):   %s   10.38 (10.78) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSCGVVAV LAVLTLGTIC EATQGSISTV LYPQFYDRSC PRANDIVRSV VAQAVAREAR MAASLIRLHF HDCFVKGCDA SILLDSSRNI VSEKLSNPNR NSVRGFEVVD AIKTALEREC  PGTVSCADIL ALAARDSTVL SGGATWEVPL GRRDSRRASL SGSNNNIPAP NNTLPTILTK FKLQRLNLVD LVALSGSHTI GMARCTSFKQ RLYNQTGNGQ PDSTLDASYA AQLRTRCPPS 
GGDNNLFFLD PPSPALFDNS YFRNILARRG LLSSDQVLFT RSAASRRLVR LYARNQAVFL RQFAQSMLKM SVISPLTGNR GEIRRNCRRV NGS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGATGAGTG AGCCATCGAT CAGTAGAGAT GTGTACTTCC CTTATTGATG ATGTCACCTT TGGTGATGCC CGTGAAGAAG AAACTTCTGC CATTGACAAT TTTCTGCTCC GGATGCTTCA  AGTGCCTCCC GTGGGATGAA CTTCAAAGTC TCCAGATCAG CTCCCTCCTT GGCTTCAGGA ATTTTGCTCT GATACCATGT TGAACAAGGG GGTAGTGGTT GACTCTTTGG ACAGTAGCAC  TTCTCAGATC ATGTAGATAG AATGATAAGA GGAAGAGAGA GAGTAGAGGA GTACACAGGA GTAAAATAAT GTGAGCACAC AATTTTATTA AGTGAGGTAG TGGGGTATTT ATACCCTTAA  AATATGACTG TTGCAATTGC ACTGTTCATA TGAACAGTGA TTACTGTTCA AACGGTAACT AGCCGTTTGA ACAGTAATTA TATTATTATA ATACTAAAAA CATAAAATTA CAATTGGCCn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnT TAGGGTCCGG AGTTTTGGGG GCAAGGGTGG GACGACAGAG CTTTTCAGGC CCGACCCACT CGCTACACGA ACCTGCGCAG GATGGGAGGG CGGGTTGAGT  AGTGGGCAGG TGTTCGGGTA GGGGAAAAAA CAAAAAAAAC CTAAATTTTA GGGCCTAAAA CTATTAATCT ATGTCACCGA TGATTCTCAA CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTTTCTCT CTCCTTGAGC CTATTTCTTC TTTTTTTTTT GAAGATGCAA GCAAACAATA ATCTAATATC CTTGATGATT  AGTCTACTGT ATGTTACACT GTTTCAGAAT AATGTATACA TATTTTAAAT ATATGTTCTA ACTATTTGGT TTAAGATTTC GACGATAAAA ATAAATGATT TGTTTTGGTT TCAGCTTCAC  AAAGTGTTAT CTTATGATCC ATAAGGTTAC AGACCGAATT CTCCAATCCA CCCAATCAGC TCCTCACCTC TGCAAGTGGC TGTCTTGGCC TCCAGCAAAC CACCACCATC TGCAGAAAAT  GGTCGTCATC TAGTGTGAGG ACGAGTGATG GGTCGAACAC CCGCCCCACC CGAACCTACC CTGCAGGTTT GAGCGGGTCG GGGAAATGAG GTCGGGTCAG ATAGATCCGA CCCGACCCGG  ACTTCCGAAG CCTAGTGTGG TTTGAGCTGG TTAGTTACAG CTAATATTCT CCAAAGGAAA CTTTTTAGGG TTTTTTATGA TAGAAAATAG GTGTTAGTTT ATGGGCCTAA TGGAACGAGG  AAAACAACTC CTCTGTCCCT ACAAATTGTA ATCCTCTAAT GGAGTAAGAA AATCAACTCC TCTGTCCGAC CCTTTATCCA TGGAAGCAAG AGGACTATAA ATGCCACGGG GAGCCAACAC 
AGTCTCGCCA GGAACACTCG AGCATTGCCT TTCTCCCTCA AGTTCAAGGA AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGGGAGAATG ATGAAGACTA CTCGGCGGGA CAACACTATG CTTCTTGTTC CTAGTTCTGT TGAATCCAAG TATGTGTTTC TCGTCGTAAT TGATGAAGGC TACTCGGCGC TTCGTCACTA  TCTATCCTAA AACTGCTAAA AATACAGGCT TTGTTCAATC AAAACTCTAC GCACGAAGGC ACCTTAGCTT AAGAAAATAC CCTTCGTGGT AGATGCCTAG TAAATATCTC CTAGTAATGG  AGGGGGGGTG ACCTTTAAGA GTCACAACAT CCTTTTTGTC TCAAAAGCGT GACCGACAAA ATTTTGAAGT CCTTAATCAA GCTAAAATCA ATGTGTGCAC CTATGATGTA TGTATGTATG  TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG  TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTACTGT TTGAGCGTGG TGGTGGCGCG AGATGCCACT GTGTATGGTA TTGATGGATG TTTATAGGGA CTAGGGTATG TTGCTCAGTG AGAGCCTACT  AAGGTTTGCA TGCTCAATCG AGTTATCTAT GGTTTCGAGC AAAGTTCTTG AGCTTGGTTT GAGAAATTTA GTCATATAGT GACTTTCTTT GCCTTTTAAT GTAGTTTAGT TGATAACTCA  ATTTTCATAA AACAAAATCC TCCAAGTTGC ATCTTTCTGG CAATTTATGT TGATAATAAT TTGCTAACCG AGAGTGATTA TTTGTAGACT CACTTTATGA CCAAGGATAT GTGTAAGCCA  AAATATTTCT TAGGGATTGA ATTTGCATAC AATAATGACA TGATGGTATT GTCAAAACAC AAATATGTTT TGGACTATTG GAAACCAGAA TTTTGGGCAG TAAACTACAA ATATCACCAA  TTGAATTTGG AGTTGTGAGA TTCTACATCT CTTGTTTGAG AATTCTAATT GATATTGCAT GTTAATGAAA AATTAATTTA TTTGACTATG AATCATACAT ATATTTCTTT TCTTTTTGGG  ATATTGAGCA AGTTTATGCA TGAACCTAGA GAGGCTCAAG AGGGTGGTTT ACGAGTTCTC ACTTGTCTTA AGCGAGTGCA AGGGAGATGA CTTATACAAA AAATAAATGT TCACTTATAT  ATTCAAACTT ATTCGGATTC AGGTATGATT GGATAATAGG ATTCAATACT TATATTGGTG GAAACTTAGT CACTTGGCAA GGTAAAAAGT AGGATGTTAT CTCTAGGTCA AGTACATAAG  TATAGTATAG AACCATGACA CATATGGTTT GTGAGTTGAT GTGGTTATGA CTCTTCTACT TGAGTCGAGT TTTCTAGTTC ACACTCTCTT GAAGATGTAT TGTGATAATT AAGTTTCATC  TTCATTGAAA GCAATCTAAC CTTTTATGAC TGCACCAAAC ATGTTGAGTT AGATTTTCAT TATATTATAG AAAAGGTTTT CCAGGGGTGT AATCTCTACT CCTCAGACAT CTATTTTGGA  GTAGTTGTCT GACATCTTCA AAAAAAAGCT CATGGATAAA TCTTATGATT TACTGTGGTA AGTGTAACAT GTAATTTCAT TCATACATGC TAAAACATCA TTTGTATCTA CTTTTAATAA  ATAGAATTAG TTCACGTTAT CATGACTTTA TTAAATTTTC ACATTCATCA TGCCATTTCG CTCAAGTATG CATTTTTACA TAGATTAGGG TCACCTATGA GAATTATTGG CATTTGACCT  TTTCCAAGGT CAAGCAAACG CTAAATTAAC CCAATGGTTT GAGTTTTCTA ATATTGCAGG CCTTGTGTGG AACATATTGA AGATGAAGAA GGGAAGAAAA GGGAAAAAAT TTAGGTTTAA 
CTTTTACAGT CAAACTAAGT CATTTAAATG CTTAATGCTT TTCTTTCTTC TTATTTTTTA TTTACAGGTG GCATTAAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTCT CCTGCGGAGT CGTGGCGGTG TTAGCAGTCC TCACTTTGGG GACGATCTGT GAGGCAACCC AAGGGAGCAT CAGTACTGTT CTCTATCCAC AGTTTTACGA CAGGTCCTGC  CCGAGGGCAA ATGATATTGT CAGGTCCGTG GTGGCCCAGG CCGTAGCTCG AGAGGCTCGC ATGGCTGCCT CTCTCATCAG GCTGCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGT ATCTCTCTCT  CTCTCTCCCC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TCCGGTTCCC AAGTCCTCAC TCGGATTCCT  GTTATGGTTA GGGTTGCGAC GCGTCGATCC TGCTGGACAG CAGCCGCAAC ATCGTGAGCG AGAAACTCTC CAACCCAAAC CGCAACTCCG TGAGAGGGTT CGAAGTGGTG GACGCGATCA  AGACAGCGCT AGAGAGAGAG TGTCCGGGCA CAGTCTCTTG CGCCGATATT CTTGCCCTCG CGGCTCGAGA CTCCACAGTT CTTGTAAGCT TTATCACAAG TCCATTCTCT CCCCTTCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTAGATTT TCCGGTTTTA TCTCGCAGAG CGGGGGGGCT ACCTGGGAGG TTCCGCTGGG GCGGAGGGAC TCGAGACGCG CGAGTCTGAG  CGGGTCGAAC AACAACATAC CCGCACCGAA CAACACACTC CCCACCATCC TCACTAAGTT CAAGCTCCAG CGACTCAATC TCGTCGACCT CGTTGCTCTC TCAGGTACTG CTTCTTTAGA  GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGTCCAG ACTTTGAGTT AATCTCTTTT TCTCTGAGTT TAGGGAGCCA TACGATCGGG ATGGCGAGAT GTACCAGCTT CAAGCAAAGA  CTATACAACC AGACGGGGAA CGGGCAGCCC GACTCGACGC TGGACGCGTC CTACGCCGCG CAGCTGCGAA CGCGCTGCCC GCCATCGGGC GGGGACAACA ATCTCTTCTT TCTGGACCCG  CCCAGCCCGG CGCTGTTCGA TAATTCCTAC TTCAGAAACA TACTTGCCCG CCGAGGTCTT CTTAGCTCCG ATCAAGTTCT CTTCACTCGC AGCGCAGCCT CACGGCGCCT TGTGCGCCTC  TACGCTCGGA ACCAGGCCGT CTTCCTTCGC CAGTTCGCGC AATCCATGCT CAAGATGAGC GTCATTTCCC CTCTCACCGG CAACCGTGGG GAGATCAGGA GGAACTGCCG AAGGGTGAAC 
GGATCCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTCT CCTGCGGAGT CGTGGCGGTG TTAGCAGTCC TCACTTTGGG GACGATCTGT GAGGCAACCC AAGGGAGCAT CAGTACTGTT CTCTATCCAC AGTTTTACGA CAGGTCCTGC  CCGAGGGCAA ATGATATTGT CAGGTCCGTG GTGGCCCAGG CCGTAGCTCG AGAGGCTCGC ATGGCTGCCT CTCTCATCAG GCTGCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGG TTGCGACGCG  TCGATCCTGC TGGACAGCAG CCGCAACATC GTGAGCGAGA AACTCTCCAA CCCAAACCGC AACTCCGTGA GAGGGTTCGA AGTGGTGGAC GCGATCAAGA CAGCGCTAGA GAGAGAGTGT  CCGGGCACAG TCTCTTGCGC CGATATTCTT GCCCTCGCGG CTCGAGACTC CACAGTTCTT AGCGGGGGGG CTACCTGGGA GGTTCCGCTG GGGCGGAGGG ACTCGAGACG CGCGAGTCTG  AGCGGGTCGA ACAACAACAT ACCCGCACCG AACAACACAC TCCCCACCAT CCTCACTAAG TTCAAGCTCC AGCGACTCAA TCTCGTCGAC CTCGTTGCTC TCTCAGGGAG CCATACGATC  GGGATGGCGA GATGTACCAG CTTCAAGCAA AGACTATACA ACCAGACGGG GAACGGGCAG CCCGACTCGA CGCTGGACGC GTCCTACGCC GCGCAGCTGC GAACGCGCTG CCCGCCATCG  GGCGGGGACA ACAATCTCTT CTTTCTGGAC CCGCCCAGCC CGGCGCTGTT CGATAATTCC TACTTCAGAA ACATACTTGC CCGCCGAGGT CTTCTTAGCT CCGATCAAGT TCTCTTCACT  CGCAGCGCAG CCTCACGGCG CCTTGTGCGC CTCTACGCTC GGAACCAGGC CGTCTTCCTT CGCCAGTTCG CGCAATCCAT GCTCAAGATG AGCGTCATTT CCCCTCTCAC CGGCAACCGT 
GGGGAGATCA GGAGGAACTG CCGAAGGGTG AACGGATCCT AG 

Retrieve as FASTA