Entry information : LminPrx85(Lemmin36g0729670.t1)
Entry ID 18883
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx85(Lemmin36g0729670.t1)
Name LminPrx85(Lemmin36g0729670.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx85
start..stop
S start..stop
LminPrx27 664 0 1..333 1..333
LminPrx103 650 0 1..333 1..333
LminPrx104 648 0 1..333 1..333
LminPrx10 625 0 1..333 1..333
Literature and cross-references LminPrx85(Lemmin36g0729670.t1)
Protein sequence: LminPrx85(Lemmin36g0729670.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (311)
PWM (Da):   %s   36237.73 (34110.7)  
PI (pH):   %s   10.35 (10.60) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSCGVVVV FSALSLAAIC TATQESIGTV LYPQFYDRSC PRAKEIVRSV VAQAVAREAR MAASLIRLHF HDCFVKGCDA SILLDSSPTI VSEKLSNPNR NSVRGFDVVD AIKAALEREC  PGTVSCADIL ALAARDSTVI SGGPSWEVPL GRRDSRRASL SGSNNNIPAP NNTLPTILTK FKLQRLNRID LVALSGSHTI GMARCTSFKQ RLYNQTGNGQ PDPTLDASYA AQLRTRCPPS 
GGDNNLFFLD PPSPTVFDNS YFRNILSRRG LLSSDQVLFT RSAATRRLVR LYARNQAVFL RQFAQSMLKM SLISPLTGNI GEIRRNCRRV NGS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTCGTCAG TGGATCTGTG ATGATCTAAT GCATGTAGCT AAACATTAAA TGATAAACTG TTTTTAAAAA ATGATGTGTA TTCCTCATTT TAGCACTCAC TAGTGTGTTG ATTTTAGTGC  ACCCACAAGT TTGGAAAAAA ACCCCATCAT TCAACCATAT GATTGTCCTG AAATATAATA TGACTGTTTA AAGCTAAGAT TCTCTTATTT CACCATGTGA TGGAAAATAA TAATACCTAA  AAATAAAAGA TAATGATATT ATTAAAGAGT ACTTTTTTCA TGACTCCTTT AAATACTTGA CAATCTACAA ATTTCCTTTG TTGTTTAGTG ACACGATGTT GAAAGTAGTT AGATGACAAT  GAACTTTTGG AAAGAGAACA CTTTATTCAA ATGAGAAACA AGAAGAGGGG TACCTCCTCT TATATAATGA GAAGCCATAC AAGAGAGATT TTCCAATGTG AGACTAATCC CACCTTAGTT  GGAGAGTGAA CTAGTTGACT CATTATTATA GTATGTCATA GAAGGAGAGG GTCAATAATG GGCTCCTACT ATGATCACCA TTGTCTTCGG CCGTGCCATC CACGAGAGGC TGGACCTCCT  CCACCATAGG TATCAACTCT AGAGCACCAA GTTGTTAGAG TGTCAACCAA AGATATTGTG TCAATGCAAA GCTTTCCATA CCTTAGACTA GTGTTCCTCG ATATAGTAAA TTCCCCATCT  CATCAAGAAT CCATGTTTCT GGTGTGATAA AAATTCGTTG ATATATATCT AGATGTTACA CCATAATGAA AGAAATCCTT GGCCTTATGC TTTCTTGATA TTGGGACTTG AATGCTCTTA  ATGGGCCCTT GAATCCTCAA AGTGATGTAT CCTCTCATAG TGGACCTCAA TGCTAGTATT GGGCTAATGG TAAAACATTG ACCTTTGCTT GTTGAGTTGT TGGGCCTTAA TGGGCCTGTT  TGAGGGTTTT TTTCTCTTCA CTTAATTTAT CTTCTCAGTG TCTTCAAGGG TCTTGTAGTG TTATAATGGG ATTGCACAAA TTAAATATCT TTACCAAAAA ATCAATTGAT GATATCTATG  TAAAATTGAA AAGGGAGCAA ATGAGGATCA AGATGTTAAT TGTCTCCTCT TTCTCCATGC AAAGTATAGG AGACAATTTA GGGAGATAAG ATAAATGAAT TAGGGAAGAT TACATAATTA  AGGGTGAAAC TTTAAGTTAC AATCAACGTT CCTTCCTTCG ATTTATTACA TTATTCTGCA ATTAATTTTC TATGAGAAAT CTCATGTGAT AATTGGGATA CAAAGTTGTC CATATATAGT  ATATAAGAGA GTTGGTTAGA TGTTCTTGAA CCTTTTTTAT TTCACATTAG GATATTTAGT CAACCTAGAG ACCTCTCCAA GTATCTCTCT TCTAAATGAA ATTGTGTTCT TCATCCTTGG  TATTCAATTT TTTGATAATA TCACTCACCA CGCTCATCAA ACAAGCATCA TTGCCAGCTT GTCTGTATCG ATGATCATAA AATCAACAGA TCTTCTCACT GAGAAAAATA CAACTTTAGG  TCTTTTTTAG GTAAATTTTT CCTTTCATCA TCGGAACAAA GGATGCCACA AAGAAAAACA TAGATGAGAG AGAGAGAGAG AGGTGGATAA AGAAGCCTCG GGATGATAGG AGTGTGATTT  GAGCAGGTTT GGTGCAGCTA ATATCCTAAA CCAAAGGGCA CTTTTAATTT TTTTATGATA AAAAATGTGT TCTTTATAGG CCCAATGGAG CAAGGGAAAC AACTCGCGTC CCACTCCCTA  CAAATCATAG CCCTCCCTCT AATGGAGTAA GAAAATCAAC TCCTCTATCC AACCCTTTCT TCTACCCTTT AGAAGCGAAA AACGCCTATA AATGACCGCG GGAACCACCA CATTCTCTCC 
AGGAACAATC GAGCATTGTC TTTCTCTCTT CACCCTCAAG AGAGAGAGAG GCAGAGAGCG AGATAGAGTG AGAAAGAGGA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCTCTCTTT TTCCTTGTTC GCTGTTATCC AAGTCTGGGA ACCGCTCCTT TATCAAAAAT TTGTATTTTC CTCATGAGCT TTATCACTAT CTACCCCTCC AAAACCTGCA TCACTAAGTC  TTATGATTTC TTCTGTTGAA TCTATCCCTT GAAAAAACAG ACAAACTCAA AGCTATTTAG GTATCATTAG AAGTCTTAAA CGTTGGAGGA AATCACGAAT GGATTGATTT CTTGAATACA  GGATAATTAA TGATTATTAA AGTTTCATGA TAGACCAAAT TTAATATTTT TGAGAATACT TGAAAAACAT TAACTAGCAA ATTTAGGGTT CCTGAATATT CAAGGTCCAA GATTGGGAGG  GTAATGTCAG TGTCAATGGC TAGTAAAGGT ATCTTCAACT GTGGGACGCA TGTTTTCCAC AAGGATTTGC CTCTGGACTT GAATGACAAG TGTTGGAGAA TGAATGGAGA GATAGATGGT  CATTTCTAAA CCATCTTGGT TCCAGTTGAA TGAAACAAAA TTATCAGTGG GTTGTTGATG GACACGTAGC CCATCAAGGT GGGAGCTAAG CGTTGCACAG TTTTCTTAAA TGACATATCT  GCTCGCACAT GCTTGAAACA TTTATCTGAC ACTTCTAAAG TGTAGGAGAT ATTCTTTTGT TCCCATACAT CCATTTCATG TATTGGGTCT GGCTGAGTGC TGTTGGTTGA CTAAAGGATG  GATCAATGCC CTTGAGCATC GAACAAATGA CCTCCCAATC AGCCTCAACC CATTTGTCAA AATATGTATC TTCTTTATGA GCTGGATGCG TGCTGAGATT CTCAGGCCTT AACCTTTGTC  GTTGTCGAAA TCCCCTCGAA TCCCTTGCAT CACCCAACCT TGATGTGCAT CATCCAGTTA TGGTCTTTGA CTTAGGTACA TCCTCCACTA TTGCTTAGGC GTACGATTCA CAAAGGATTC  AACAGCTAAT AAATAGTCCC ATTGACTCAC AAAGAACCCT CCAGCCCGTC AAGGATTAGT GACTCACAAA GAGTCCTCCA ATCCACCAAG GATAACCTAC TCACGAAGAG AACTTGTGCT  ACCAATGATC ACAACCTTAC AAAGAGTCAT CCAATTGACC AATGGTCCAT CATGACACAA GGTGTTCCCA AGTGTAATGG TTTTTCTAAT TCAATCATTC TTTCTACTAA TAATATAAAT  TATAAAGAAT AATGTAACAA TTTATATAGT AAGATAAAAT CCTCCTTGAA AATATCGAGT CAGACCCAAA AAAATTCCCC GATACGATTA CGCACCTAAG CGCTTCGAGT TAGGGCGACA  CTCGAGTCCA TCCCTGAACT GGCATGATCG AGCACCACCC AGGTAGACGC TATGACAAGC ATTATCTCAC TAATGACAAT CGGCGAGACT GTTACCAATA GAGATGTCAA TCAGCAATGC  CCATGGTGGG TATGATCATC CCCGATATAT GCAACATTCA ATGTCATGAT GACGATTACA ATCGTTGTAA TGATCGTAGG CCGTCGAGCA ATGCCCATGG TGGGTATGAT CGGGATTATC  TCGATAGACG TTATGATCTT CCGTGACGGT ACGAATACAA TCAGCAAGAG GACCGGTGAC CATATGGACA CAATCACGAT GCCATAGTTT GAGAATACCC GAAGCTCGAA CTACCCACGT  CGAGATGAAT TTGATTGAAG GGATAATTGC CGACCTCACA ATCGTAACGA GTTACATCGT GACCATCAGT GTGCATGAGC CGAGTATCGT GCACCGCATG ATGGCTCGTA AGAACCAGCC  AAATATTGGA AGCACGGCTT GAGTCCACCT CGACACTACG ATAGACCTCA ACATGATTAC TACCAAAGAC CTGGTTGGCG CCACGATTGC GAGTAGCTAC GAGATGAGCA TCGTCTAAAT 
CTAGAATAAT CTGAAGACGA AAATACCTAT CATTGAAGGC TCTTGAGAGC CTATGGATTT TATCAACTGG TAGTCTAATA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTTT CCTGCGGAGT CGTCGTGGTG TTTTCAGCCC TCAGTTTGGC GGCGATCTGT ACGGCTACGC AAGAGAGCAT CGGCACTGTT CTCTATCCTC AGTTTTACGA TAGGTCCTGC  CCCAGGGCGA AGGAGATTGT GAGGTCCGTC GTGGCTCAGG CCGTCGCTCG AGAGGCCCGC ATGGCTGCCT CCCTCATCAG GCTCCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCT CTGTGAATGT AGCATTCATG TGGGCGCGTA TTTTGGTTAA GGGCTGCGAC GCGTCGATCT TGCTGGACAG CAGCCCCACC ATCGTGAGCG AGAAGCTCTC CAACCCAAAC  CGCAACTCCG TGAGAGGGTT CGACGTGGTG GACGCGATCA AGGCAGCGCT AGAGAGGGAG TGCCCCGGCA CCGTCTCTTG TGCCGATATT CTTGCCCTCG CCGCTCGAGA CTCCACCGTT  ATTGTAAGCT CTCTCTCGCT CTGTCTCGAT CATCCATCCA GCCTTGATGT TTACGGGTTC AATCTCGCAG AGCGGCGGGC CAAGCTGGGA GGTTCCGCTG GGGCGGAGGG ACTCGAGACG  CGCGAGCCTT AGCGGGTCGA ACAACAACAT CCCCGCACCC AACAACACGC TTCCCACTAT CCTCACCAAG TTCAAGCTCC AGCGACTTAA CCGCATCGAT CTCGTCGCTC TCTCAGGTAC  TGCTTCTCTC TCTCCTTGCG AATACGATTC AGATAGAGAG AGAGAGAGCG TCAAGAACTA ATCAGGGAAA AGAATCAGTA AACTAATACC CATAGAGAGA ATTCAAACGC TCTGTTCGTC  TCTTTTATCT GTGTTCAGGG AGCCATACGA TCGGGATGGC GAGATGCACC AGCTTCAAGC AAAGGCTATA CAACCAGACG GGCAACGGAC AGCCCGACCC GACTCTGGAC GCGTCCTACG  CCGCGCAGCT GAGAACGCGC TGCCCCCCCT CGGGCGGAGA CAACAACCTC TTCTTTCTAG ACCCGCCCAG CCCGACCGTC TTCGATAATT CCTACTTCAG AAACATACTC TCCCGACGGG  GGCTTCTCAG CTCCGACCAA GTTCTCTTCA CTCGCAGCGC AGCCACGCGG CGCCTGGTGC GCCTCTACGC TCGCAACCAA GCCGTCTTCC TCCGCCAGTT CGCGCAATCC ATGCTCAAGA 
TGAGCTTAAT TTCTCCTCTC ACCGGCAACA TTGGGGAGAT CAGGAGGAAC TGCCGAAGGG TGAACGGATC GTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTTT CCTGCGGAGT CGTCGTGGTG TTTTCAGCCC TCAGTTTGGC GGCGATCTGT ACGGCTACGC AAGAGAGCAT CGGCACTGTT CTCTATCCTC AGTTTTACGA TAGGTCCTGC  CCCAGGGCGA AGGAGATTGT GAGGTCCGTC GTGGCTCAGG CCGTCGCTCG AGAGGCCCGC ATGGCTGCCT CCCTCATCAG GCTCCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGG CTGCGACGCG  TCGATCTTGC TGGACAGCAG CCCCACCATC GTGAGCGAGA AGCTCTCCAA CCCAAACCGC AACTCCGTGA GAGGGTTCGA CGTGGTGGAC GCGATCAAGG CAGCGCTAGA GAGGGAGTGC  CCCGGCACCG TCTCTTGTGC CGATATTCTT GCCCTCGCCG CTCGAGACTC CACCGTTATT AGCGGCGGGC CAAGCTGGGA GGTTCCGCTG GGGCGGAGGG ACTCGAGACG CGCGAGCCTT  AGCGGGTCGA ACAACAACAT CCCCGCACCC AACAACACGC TTCCCACTAT CCTCACCAAG TTCAAGCTCC AGCGACTTAA CCGCATCGAT CTCGTCGCTC TCTCAGGGAG CCATACGATC  GGGATGGCGA GATGCACCAG CTTCAAGCAA AGGCTATACA ACCAGACGGG CAACGGACAG CCCGACCCGA CTCTGGACGC GTCCTACGCC GCGCAGCTGA GAACGCGCTG CCCCCCCTCG  GGCGGAGACA ACAACCTCTT CTTTCTAGAC CCGCCCAGCC CGACCGTCTT CGATAATTCC TACTTCAGAA ACATACTCTC CCGACGGGGG CTTCTCAGCT CCGACCAAGT TCTCTTCACT  CGCAGCGCAG CCACGCGGCG CCTGGTGCGC CTCTACGCTC GCAACCAAGC CGTCTTCCTC CGCCAGTTCG CGCAATCCAT GCTCAAGATG AGCTTAATTT CTCCTCTCAC CGGCAACATT 
GGGGAGATCA GGAGGAACTG CCGAAGGGTG AACGGATCGT AG 

Retrieve as FASTA