Entry information : LminPrx104(Lemmin40g0763580.t1)
Entry ID 18902
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx104(Lemmin40g0763580.t1)
Name LminPrx104(Lemmin40g0763580.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx104
start..stop
S start..stop
LminPrx103 674 0 1..333 1..333
LminPrx85 648 0 1..333 1..333
LminPrx27 642 0 1..333 1..333
LminPrx10 623 0 1..333 1..333
Literature and cross-references LminPrx104(Lemmin40g0763580.t1)
Protein sequence: LminPrx104(Lemmin40g0763580.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (311)
PWM (Da):   %s   36182.71 (34103.7)  
PI (pH):   %s   10.32 (10.56) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSCGVVVG LTVLSLAAIC TGTQESISTV LYPQFYDRSC PRAKEIVRFV VAQAVAREAR MAASLIRLHF HDCFVKGCDA SILLDSSPTI VSEKLSNPNR NSVRGFDVVD AVKAAVEREC  PGTVSCADIL ALAARDSTVL SGGPTWEVPL GRRDSRRASL SGSNNNIPAP NNTLPTILTK FKLQRLNLVD LVALSGSHTI GMARCTSFKQ RLYNQTGNGQ PDPTLDASYA AQLRTRCPPS 
GGDNNLFFLD PPSPTVFDNS YFRNILSRRG LLSSDQVLFT RSAATRRLVR LYARNQAVFL RQFAKSMLKM SLISPLTGSN GEIRRNCRRV NGS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTCCCCTTT CAGAAGCCAT CCAACCTTAA TACCTAGGCT CCCTGAGGAT TCGACCCTGA CTTACCATTG TCCTAAGTCA GAAAAATATA AATATTGTTG CATAAAATCG ATTCACAACA  ACGACTGACA ACACCGCAAA GTCGAGTTCA TCAGTCCCCT ATCCTATACA TTTGGTAGAG AATAGAAGAG TGGTGCAAGT AACGAAAATG GAGAGAAACC AGGAGAGAAA GGAGAGAACA  TGCGCTAAGT CAATGGTGGG CCTTAGTATC TTCTAATAGC TAGGAATAAC TCTATATTTA TTTATAAACT ATAATTCAAT TAATTCTGAT TTGATCTAGA TTAGTACTTC ATATTATTAA  TGAATTCCCT AATTAACATA AAACAATATA TAAAAATAAA TATTTTTGAA ATTGAATTAT TCTCTGAAAA ATAATTATCC TAACATTTTT ATTATTATAT GGGATTTTTT ATTCAAAACA  TTTTTAATTT AGTCGTATTT CATTGGCAGA ATTATGTGAA ACTAATCTTA TGCTTCTTTT GGTTATTACG TGCAATCACT TGTCTAGTTG TCTAAATTTT GTCGTTCCCT TAATCTGAAA  ATTCTACATA TTTTATCACA GTATAATTGT CTCATTTTGG TTGCCTGGAA ATTTATAAAA TTGTATTATC ATCTATTTAC TATCATCTCT ATTGATTCGA GTTTTTAAAG AGATTTTAAT  TATTTCAAAC ATCTACTTGC CTTGAAAGTA TCCAACAATC ATAGAGAGTG ATTAATGCAG GTTCTTTGCT CCCAATTGAA TTATTTGTAT ATTTTATTTC ACAAGCACTT TATCTCTTGT  TAAAAGGGGC TTCCCCCCCA TTTAATTATT TGAAGGCATA TTAATAAAAA TGAGTAGAAG ACATCAAGAT TCAAGCCCAT TAATAAATAT GTCAGGGCAC ACTAAGCCTC AACAATTTTA  AAGAGGCCAA ATTTGCCTTA TATATCCTTG TGTGTGTCAT TATTATCCTA TTTTAAAGCT GGTTCAAGAA CATTTCTGTT AAGTATATAT CGGACCTATT AATAACAAAG GAATCCCATT  ACAAGGAGGA AACCCATTAA GCAAATACAA CTCTTATAAC CGATTCTTAC TCTTGCTATA GCCTAACTCA AAAATTAAAA AAATTGTGTT AATCAACGTT TAATATTATA GCAATTACCC  ATTAATCAGA TTTATTCTCA TATGAATTTC TATTAGAATG ACATGTAAGT GCTCTAGTAG TATAGAAATT TATACTCCAA TGCATTTGGA TCCACGAAAG ATCCGAAAAC TTGAAGGAGA  AAACAAGACG TTTCTTTTGT CCCTTCGAAG CATAAGGAAA TAAAGGTATA TATAAATATA ACGTGTACAA AGGTATGAAC CCATGGAGAG ATTTATTCGG AATGTCGTTG TATTTTGATC  GTCAAGACAT TAGGGATGAT AAGTTAACAC CAAACATCTA GAGTATCTGT TTATGTACAC AATGTGTATG TTTCATTCTG ACAACATTAG GTCACAGACT AGATAAATCA CCAACAATAT  CAGGTAATAT TTTCCTTTCA TCATGGGAAC AAAGGATATG GCAGAGGGAA ACAGAGAGAG GAGAGAGAGG GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GATAGCGGTG GATAAGGAAG CCTTGGGATG  ATAGGAATGT GATTTGAGCA GGTTTGCTCC AGCAAATATC CTAAGCCAAA GGGCACTTTT GGGAATTTAA TGATATAAAA TGTGTTGGTT ATAAGCCTAA TGGAGCAAGG GAAACAACTC  GCGTCCCATT CCCTACAAAT CATAGGCCTC TAATGGAGTA AGAAAATCAA CTCCTCTATC CAGCCCCTTC TTTACCCATT AGAAGCGAAA GAGACCTATA AATGACCCCG GGAACCACTG 
CATTTCCTCC AGGAACAATC GAGCATTTCC TTTCTCTTCT CGGTCCAGGG AAAGAGAAGC GAAGAGCGAG GGAGAGAGGA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCGTGACTG AGAGTGCGGC ACGATAATAT TATCTTTCGT TTTCCTTGTT CGCTGTGAAC CAATCGGAGT CTCTCCTTTT TCAAACATTT ATATTTCCCT ATCAGCATCA TTAGTCTCTC  CCCCTCCAAA ACCTGCTGAG AATACGGGTT TTATTCAATC TCCCCCTTTA TACGTCATTG GATGACCCTT TACCAACCAC AACAACCTTC TTCCACCATG AGGATTCAAA GTAGGGAACG  GAAGACCACG ATCCACGATC CACGATCCAG ATTGTGGATC TGATCTACGA TCCGATTTTT CAAAACCTGT GATTTTGATC TAATCTACTA CGATCACAAT CATGATCGCG ATCATGATCC  CCTGATCTTA CCTTTATTTT CAAAAAAATC TTTTTAACAT TTAATTTATT TAAAATCAAA ACAAATATGC TAGTATTAGT ATAAAGATAT TTATAGATCT AGCTATGAAA AAATGGAATT  ACATGTTTGA TTTAAAATTG AATATGTTTA GTATAATTAT TATTCTCAAA TGAAGATGAT TATAAATCAT TATTAAAAAT ACGATTTTTT CTAATACTAT AAATTATCTT GAAGTGTATC  GAGATTAATT ACAAATATAA AAACTTAATT GCATTTTTAA AATTGATAGG TGTGTAACTA TAAAATTAGA GAATGCTCAA TATTATATAA TTGAATTTAG TCTCAAAGAA AGTATATATA  TACATGTAGA ATAATGGAAA GATATAATCA CTAGCAGCTG ATTGAAAATG AAAAAATTTG ATATAACTTT GCCTTAAAAT TAGAGAATCC ATTACAAAAA CAAGATGAAG AGGAATTCAA  AGAAGATGAC GAATAAGAAT TAGAAGAATT TAAAGAAGAA GAAAAATTAG AAGAACTAAA ATAAGATGAA GAAGAAACAT AAGAAAGGAA TGAGCCGTAT CAAAAGAAGA TGAAAAAGAA  AAAGAAGAGG AAGAATTAGA AGAATTCAAG GATGATGAAG AAGAAATCGA TGAAGAATAA GAATTAGAAT AATTAAAAGA AGATGAAGAA GAAAGAGAAG AAAAATAATG AGAAGTATCA  AAATAAGAAG AATAAAAAAA TTATGAAGAA GAAACAGAAT TAAAATAAAA TTAGTAGAAT TAAAACAGAA GGAGAAAAAG AAGAAGAAGG AAGAATTCAA AATAAAATAA AATAAGGTGA  AGAATAAACA GAAGAAAAAT AAAATTAGTA GAATTAAAAC AGAAGAAGAG GAAGAATAAT TGGAGGAATT AAAATAAAAT TAGTAGAACT AAAACAGAAG AAGAAGAAGA AGAAAAAGAA  GAAGAATTAG AGGAATTAAA AGAAGAAGAG GAAGAATTAA AAACAAAAAT AAGATGAAGA AGAAACAGCA GAAAAATAAA ATTAGTAGAA TTAAAACAGA AGAAGAAGAA GAAGAAGAAG  AAGAAGAAGA AGAAGAAGAA GAAGAAGAAG AAAAAGCAGA AGAAGAATTA GACGAATTCA AGGTTAAGCG TATCCCTGAC AATCAAGAAC AGGCTGAGGA ACAAGACGAC TGTGATTCTA  GAGGTCATGA TCTGCTGCTC CACTTACTTG GGGATTTTCC TCCCTCCTCG AACCGCCTCC ACCAGAAGTA GAGCCAGAGA ACCTCCATCG AGCGCTGGCA ATGGCAGAAG ATTAATGACG  GTGAGGTTGA GGTTTATCAC GGCGGCGAAC TGGAAGATCC GTCGGCATTA GATCTCGCCA CTTCCGCACC CACAACGATG ATCGCCACCG GTCAAGAAAC CTTCTCCACA GTCTGAGAAA  AATTGAGGAA CGTTTGCTTC AATCCCTCAA GAACAGTAGA CATCAATGCC AAGAATTCCT TCCCCGAGAA TCTGATCACT TCCGCAAAAT CAAGCACCCA AATCGCGCGA ATCGGACGGC 
CCAAATCGCG CGGACCAAAT CAAAGCCAAA TCCCTGCTTA ATCTGGGTCG TCCGCGCGTT ATTCGTGCGA ATCGGACGGC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTCT CCTGCGGAGT CGTCGTGGGG TTAACAGTCC TTAGTTTGGC GGCGATCTGT ACGGGTACGC AAGAGAGCAT CAGCACTGTT CTCTACCCTC AGTTTTACGA TAGGTCCTGC  CCCAGGGCGA AGGAGATTGT GAGGTTCGTT GTGGCTCAGG CCGTCGCTCG AGAGGCCCGC ATGGCTGCCT CCCTCATCAG GCTCCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGT CTCTCTCTCC  CCCCCCTCTC TCTCTCCCTC TCTCTCTCTG GCATTCATTT GGGCGCGAGT TTCTTTGAAG GGCTGCGATG CGTCAATCTT GCTGGACAGC AGCCCCACAA TCGTGAGCGA GAAGCTCTCC  AACCCAAACC GCAACTCCGT GAGAGGGTTC GACGTGGTGG ACGCGGTCAA GGCAGCGGTA GAGAGGGAAT GCCCCGGCAC CGTCTCTTGT GCCGATATTC TTGCCCTCGC CGCTCGAGAC  TCCACCGTAC TTGTAAGCTC GCTCAAACGT CCCTTCTATC CCCTTCTTTC TTTCTCTCTC TAGACTTTCT CTCGACGTTG ATATTTACCG GTTGAATCTC GCAGAGCGGC GGGCCAACCT  GGGAGGTTCC GCTGGGGCGA AGAGACTCGA GGCGCGCTAG CCTCAGTGGG TCCAATAACA ACATTCCCGC ACCCAACAAC ACTCTCCCTA CCATCCTCAC CAAGTTCAAG CTCCAGCGCC  TTAACCTCGT CGACCTCGTC GCGCTCTCTG GTACTCCTTG TTTCTTTGTT TGCGAATATG ATACAATGAG AGAGAGAGAG AGCGTCAAGA GCTAAACAGG GAAAAGACTA AGCAAACTAA  TTCCCGGAGA GAGAATTCAA ACGCTCTGTT CGTCGCTTTT CTTTGTGCTC AGGGAGCCAT ACGATCGGGA TGGCGAGATG CACCAGCTTC AAGCAAAGAC TATACAACCA GACGGGGAAC  GGACAGCCCG ACCCGACGCT GGATGCGTCC TACGCCGCGC AGCTGAGAAC GCGCTGCCCC CCCTCGGGCG GAGACAACAA CCTCTTCTTT CTAGACCCGC CCAGCCCGAC TGTCTTCGAT  AATTCCTACT TCAGAAACAT ACTCTCCCGA CGCGGGCTTC TCAGCTCCGA CCAAGTTCTC TTCACTCGCA GCGCAGCCAC ACGGCGCCTC GTGCGCCTCT ACGCTCGGAA CCAAGCCGTC 
TTCCTCCGCC AGTTCGCGAA ATCCATGCTC AAGATGAGCT TAATTTCCCC TCTCACTGGC AGCAATGGGG AGATCAGGAG GAACTGCCGA AGGGTGAACG GTTCCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTCT CCTGCGGAGT CGTCGTGGGG TTAACAGTCC TTAGTTTGGC GGCGATCTGT ACGGGTACGC AAGAGAGCAT CAGCACTGTT CTCTACCCTC AGTTTTACGA TAGGTCCTGC  CCCAGGGCGA AGGAGATTGT GAGGTTCGTT GTGGCTCAGG CCGTCGCTCG AGAGGCCCGC ATGGCTGCCT CCCTCATCAG GCTCCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGG CTGCGATGCG  TCAATCTTGC TGGACAGCAG CCCCACAATC GTGAGCGAGA AGCTCTCCAA CCCAAACCGC AACTCCGTGA GAGGGTTCGA CGTGGTGGAC GCGGTCAAGG CAGCGGTAGA GAGGGAATGC  CCCGGCACCG TCTCTTGTGC CGATATTCTT GCCCTCGCCG CTCGAGACTC CACCGTACTT AGCGGCGGGC CAACCTGGGA GGTTCCGCTG GGGCGAAGAG ACTCGAGGCG CGCTAGCCTC  AGTGGGTCCA ATAACAACAT TCCCGCACCC AACAACACTC TCCCTACCAT CCTCACCAAG TTCAAGCTCC AGCGCCTTAA CCTCGTCGAC CTCGTCGCGC TCTCTGGGAG CCATACGATC  GGGATGGCGA GATGCACCAG CTTCAAGCAA AGACTATACA ACCAGACGGG GAACGGACAG CCCGACCCGA CGCTGGATGC GTCCTACGCC GCGCAGCTGA GAACGCGCTG CCCCCCCTCG  GGCGGAGACA ACAACCTCTT CTTTCTAGAC CCGCCCAGCC CGACTGTCTT CGATAATTCC TACTTCAGAA ACATACTCTC CCGACGCGGG CTTCTCAGCT CCGACCAAGT TCTCTTCACT  CGCAGCGCAG CCACACGGCG CCTCGTGCGC CTCTACGCTC GGAACCAAGC CGTCTTCCTC CGCCAGTTCG CGAAATCCAT GCTCAAGATG AGCTTAATTT CCCCTCTCAC TGGCAGCAAT 
GGGGAGATCA GGAGGAACTG CCGAAGGGTG AACGGTTCCT AG 

Retrieve as FASTA