Entry information : LminPrx27(Lemmin4g0117840.t1)
Entry ID 18825
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx27(Lemmin4g0117840.t1)
Name LminPrx27(Lemmin4g0117840.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx27
start..stop
S start..stop
LminPrx85 664 0 1..333 1..333
LminPrx103 644 0 1..333 1..333
LminPrx104 642 0 1..333 1..333
LminPrx10 620 0 1..333 1..333
Literature and cross-references LminPrx27(Lemmin4g0117840.t1)
Protein sequence: LminPrx27(Lemmin4g0117840.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (311)
PWM (Da):   %s   36202.75 (34123.7) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   10.27 (10.60) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGYSCGVVVV LSALSLAAIC AATPESIGTV LYPQFYDRSC PRAKEIVRSV VAQAVAREAR MAASLIRLHF HDCFVKGCDA SILLDSSPTI VSEKLSNPNR NSVRGFDVVD AIKASLEREC  PATVSCADIL ALAARDSTVI SGGPTWEVPL GRRDSRRASL SGSNNNIPAP NNTLPTILTK FKLQRLNRID LVALSGSHTI GMARCTSFKQ RLYNQTGNGQ PDPTLDASYA AQLRTRCPPS 
GGDNNLFFLD PPSPTVFDNS YFRNILSRRG LLSSDQVLFT RSAATRRLVR LYARNQAVFL RQFAQSMLKM SLISPLTGNI GEIRRNCRRV NGS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGGAAAGAAT CAAGTTGATA TTTATCAGCC CATGGCCCAA TAAGGCAGTC TAATAATCTC ATTGGTTTGG CTCTTCTTAA ACCTAAGGAG GTCATCCAAT TAGTTGATGA TGATGATTTT  CACCTCTTTA AAAAATGATA AATATCATCA GGCTTTTCAA TGGAAACATG AAAAGTCCAA CTCTTGGTGC TTCCTCTAGA CAAGTTGCTG TCCTAGATTG GGGAATAATA GGCCAATTCA  GGGCCTGAGG ATTAATTAGA TTAGGACATT TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTACTGTTT TACACAGAGT ATGAGCAATC  CGACAAAGGC TCTCTCCTAT CTTATATCTA TGTAACAATC GTTAGTTCCA AATGGGGTGG AACCCGTTGA GTTTTCTTTG TGATAGAGAC AGTTTCATCA TTTTCCTGAA TGATAATACT  TAGAGAGAGA GAGAGGGAGG GAGAGAGAGA CGGACGAAAA ATAGACGAGA CAGCAAGGTA TTGGCAAGAC ACGTGGAAAC CAGTAACGCC TTCTCCTGTC TCGGTGGCCA TCGTCCACCA  TGGCAAGGCC CTAAAATGCC AAAATGGCTC ATAAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGATC AGGGGCGAAA AGAGAAAGAG GAGAGAGGAA ATGACGGGAG GATAGAAAAG  AGGATAGGGC GAGGGGGGAA GAAAGGGGAG GAAGAGATAT AGAGATAGAC AGGAGCAAAG GAGACTGAGA TGAGTGCACA GGGATCCTTT TGTGGGAGCT GTTCTCGAGA AGCAGTGCCT  CTCTGACAGA CTAACCGGAT GTCCTGCACA AAATGAGCAC AAGCATGGCA GGCCCAGTAT TTGCTGCATG AGCCCAGAAA CAGAAGGCGC CCACTAACTG AGAAGGACCC ACTGCAATGG  GTCTAAAATT AGGTTAGTTA TCTTTGCAAT GGGCCAAAGA AGGGACCCGC GCCTCTGCCG TAGGCAAGCA CGAGAACGTC TGCGATGGAG GGGTGTCACA AGTCGATTGT TGACTGGGGT  AGGTGCCGCT GAGAAATGGC ACGGCCGGAG GGATATTGAT CATCGAGGAG TGTCACATCA CCGCAAGAAG CACCACGTCA ATAGAAGAAA TACTAGATGC ACCTAGGGCT CTAATACCAT  GTGGAACATT ATAGAATAGC AACTCAAGAG AGGAGAGAGC CTCATCACTT TGGTCAGTGA GGAGGAGACC CTACACAAAA GAGAGCCGAG AAGGAAGAAT TTTAGTGATG CCCTTAGGCC  CATATATACT CGCAAATATA AATATAGAAT TTGAAGATTA ATTGATTCTA CTTGCTTGTC TATCAACCAA TCCCAATACA TGTTTTTCCT TAATGGCTTG ACTTACTGCA GCTTCTAAAG  ATGTGTCTCG CCAATACCCT CTCTCTCTCT CTCTCCCCCT CTCTTTATCA GTCTCATTCT TACTCTCCCT ACCCTTCCCC CCTCTCTCTC TCTCTCTGGG TGCATCTCTC TCCCGCTCTC  TATTCTATGT GTTTGTGTCT CTCCCTTTCT CTCTCCCTCT CTCTATCAGC CTCTCGTTCT CACTCTCCCT ATCCCTCTCT CTCTCGTTTT GTATTATATA TATAATATAT GAATAAATGG  ACAGATTTAT TGCTGCAGTA AATATCCTAA TCCGAAGGGG GCTTTTTGGT CTTTTTATGA TATAAAATGA GTTGGTTACA AGTCTAATGG AGCAAGGGAA ACGACTCGCG TCCCATTCCC  TACAAATGAT TCCCCTCTCT AATGGAGTAA GAATATCAAC TCCTCTATCC AACCCTTTCT TCTACCCTTT AGAAGCGAAA AACGCCTGTA AATGACCGCG GGAACCGCCA CATTCTCTCC 
AGGAGCAATC GAGCATTGTC TTTCTCTCTT CACCCTCGAG AGAGAGAGAA GTAGAGAGCG AGATAGAGTG AGAAAGAGGA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCGAGGCTG AGAGACTGAG AAGACAGCAG GAAAATACTA TCTTTGTCAT TTTTCTTTCC CGCGTTGTAG CGTTGACATT TTATCAAGGG AATCTTTGTT TGAAGAAAGA CTTGGTCAAC  GAGGCCTTGA ACCAAACCGG TTCAAGGGAG TTGAACCAGA CCGGGCCGGC TGACATGAAC CAACCGCCGT GAACCAGGAC GCAACTGCAT TCAGCCCATG GCTGCCTCCC TAGTGAACCA  CATTCAATGC CATCATTAAC CCTCTCAACG GCTCTTTTAT AAACATTATA AATAGAAATT AGGTTTACAA CAACTCTTGT AGGAGATTCA GTAGATGCAT TTCTTTCCTT CTTAATTCTT  CTTCTTTCCT CTTTCTCCAT AGTGCTCCTC TGCGTCTAAC TTTGATCAAG ATCCTGCGAT TCCTCGTAGC TCCACATCCC AAGGGTCCAT GACGCCGCTG AGTTCTTCCC TTGTAGTCTC  AAAATTGACG GTGATGTCGA TTACGGCAAG CTTCTCCATA CCTCTCACAT TTACTCGGGA GAATATTTTA CTTTGGAAGA TAGCTTCTCC CAATGCTCAA TGGATGCGGG CTTCATCATT  TTCTTGAATA AGATACTCCT CCACTCTTTA CCATCCATCA AAACAGGCAA CTCTAGATCG GTCTAGAATA TCAGGAATGG TGGAGGACCA ATCAGCAGGT GTTGTCTCTC ATCAACAACT  TTGTGTCTTA ATTGGTGCTT CCAGTGGCTG TCAACAAAAA ATTGTAAAAG AAGCATGGGA ATTGCTCAAT AAGATCTTCT AGTCTCAAAA TCCATCCCGG ATCATGAGAT TGCACAACAA  GACGCACGAC TTGCACAAGG GATCCACATT CCTTGAAGAT TATATCAAAG AACTATGAAT AACCTCCAAT GAATTAGAAG CTCCAAGGCA ACATGTTCAA GAATCCGTTA TCACTTATGC  GCTCCTCAAA GGCCTCAGAA CAGACTACGA CATCTTTGTG GAAGAATCAA CACACACATC AGACGATGTC ATAGAACAAG CGAGATCTTT TGATTGACTG AATGTTTACA GGGAACACAC  CAAATCCGTT GGCGACCTGC AACCTTATAC CAATCAAGCA CATTAAAATA TAAACAATGG AGGAAGATCC ACTCGAGGAC AAGGAAGGAA TAATCAATAT ACACCTTGCT CCCATATTTG  TGAACAGTAT GTACCCAACA TATCCATGCA ATCGAAGGTA CAGTAAAATT ATCCAAAGGT TGGGAAAATA ATTATCAGAA TCCAGCTTCA CTTCATCATA GGTCAACAAC CTCCTCAAGA  ATACTAATGA CCAACTATGT GCCCTCTAAA GCATCCACAT CTTGGATATG GTTCTTGATA GCAAGGCTAC TCATCATGTG GCCCCTAATC CAATGATTAT TAACAACCTA CATCCACATC  TAGGAGCGGA TCAACTACAT ATAGGTAATG GCCAAGGTTT GCAAACTCCT TCCTATGGCT CCTCTAACTT AGATTCATTA CAACTTTGGA ATATAATTTA TGTTCCCCAA AATACCAAAA  ATCTTGTTTC AATTTGAAAG CACACTACTA ATAATAACGT GCTTTTATAA TTTCACTCTA CTTATTGCCT TGTCAAGGAC AAGAGGGCTG GGTGAGTATT TCTCTAGGGT ACCCCTGAAA  ATGGACTTTA CCAATTGATT GCTTCGACCA AAAGTCCGAT TTCCACATTA GGGGATAATA TTTCACAAGG TCCATGGCAC AATCAGTTGG GATCTCCCAA AAATAATATT CTTCAGCATG  TAATCCGCAC CTTTGGCTTA CGCCCTACAC TTTTTTACAA AAATATTGTT TGAAAGTCGT ATTGTCTTCC TAAAGTTAAA AAATCTCCAC ATTTTTCAAC AAACATCAAA CTATAAACGA 
CTCAAATTGA TACATTAAGA TCTTTGGGAG CTGGCACTTG TAACCTCTCA CTATGGTTTC ACATACTATG TCTTAACTGT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTACT CCTGCGGAGT CGTGGTGGTG TTATCAGCCC TCAGTTTGGC GGCGATCTGC GCGGCTACGC CAGAGAGCAT CGGCACTGTT CTCTATCCTC AATTTTACGA TAGGTCCTGC  CCCAGGGCGA AGGAGATTGT GAGGTCTGTC GTGGCTCAGG CCGTCGCTCG AGAGGCCCGC ATGGCTGCCT CCCTCATCAG GCTCCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTGT GAATGTAGCA TTCATGTGGG TGCGTATTTT TGCAAAGGGC TGCGACGCGT CGATCTTGCT GGACAGCAGC CCCACCATTG TGAGCGAGAA GCTCTCCAAC  CCAAACCGCA ACTCCGTGAG AGGGTTCGAC GTGGTGGACG CGATCAAGGC ATCGCTAGAG AGGGAGTGCC CCGCCACCGT CTCTTGTGCC GATATTCTTG CCCTCGCCGC TCGAGACTCC  ACCGTTATTG TAAGCTCTCT CTCGCTCTCT CTTGATCATC CATCCAACCT TGATGTTTAC GGGTTCAATC TCGCAGAGCG GCGGGCCAAC CTGGGAGGTT CCGCTGGGGC GGAGGGACTC  GAGACGCGCG AGCCTTAGCG GGTCGAACAA CAACATCCCC GCACCCAACA ACACGCTTCC CACTATCCTC ACCAAGTTCA AGCTCCAGCG ACTTAACCGC ATCGATCTCG TCGCTCTCTC  AGGTACTGCT TCTCTCTCTC CTTGCGAATA CGATTCAGAT AGAGAGAGAG AGAGAGCGTC AAGACCTAAT CAGGGAAAAG AATCAGTAAA TTTATACCCA GAGAGAGAAT TCAAACGCTC  TGTTCGTCTC TTTTCTCTGT GTTCAGGGAG CCATACGATC GGGATGGCGA GGTGCACCAG CTTCAAGCAA AGGCTATACA ACCAGACGGG CAACGGACAG CCCGACCCGA CTCTGGACGC  GTCCTACGCC GCGCAGCTGA GAACGCGCTG CCCCCCCTCG GGCGGAGACA ACAACCTCTT CTTTCTAGAC CCACCCAGCC CGACCGTCTT CGATAATTCC TACTTCAGAA ACATACTCTC  CCGACGGGGG CTTCTCAGCT CCGACCAAGT TCTCTTCACT CGCAGCGCAG CCACGCGGCG CCTGGTGCGC CTCTACGCTC GCAACCAAGC CGTCTTCCTC CGCCAGTTCG CGCAATCCAT 
GCTCAAGATG AGCTTAATTT CCCCCCTCAC TGGCAACATT GGGGAGATCA GGAGGAACTG CCGAAGGGTG AACGGATCTT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTACT CCTGCGGAGT CGTGGTGGTG TTATCAGCCC TCAGTTTGGC GGCGATCTGC GCGGCTACGC CAGAGAGCAT CGGCACTGTT CTCTATCCTC AATTTTACGA TAGGTCCTGC  CCCAGGGCGA AGGAGATTGT GAGGTCTGTC GTGGCTCAGG CCGTCGCTCG AGAGGCCCGC ATGGCTGCCT CCCTCATCAG GCTCCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGG CTGCGACGCG  TCGATCTTGC TGGACAGCAG CCCCACCATT GTGAGCGAGA AGCTCTCCAA CCCAAACCGC AACTCCGTGA GAGGGTTCGA CGTGGTGGAC GCGATCAAGG CATCGCTAGA GAGGGAGTGC  CCCGCCACCG TCTCTTGTGC CGATATTCTT GCCCTCGCCG CTCGAGACTC CACCGTTATT AGCGGCGGGC CAACCTGGGA GGTTCCGCTG GGGCGGAGGG ACTCGAGACG CGCGAGCCTT  AGCGGGTCGA ACAACAACAT CCCCGCACCC AACAACACGC TTCCCACTAT CCTCACCAAG TTCAAGCTCC AGCGACTTAA CCGCATCGAT CTCGTCGCTC TCTCAGGGAG CCATACGATC  GGGATGGCGA GGTGCACCAG CTTCAAGCAA AGGCTATACA ACCAGACGGG CAACGGACAG CCCGACCCGA CTCTGGACGC GTCCTACGCC GCGCAGCTGA GAACGCGCTG CCCCCCCTCG  GGCGGAGACA ACAACCTCTT CTTTCTAGAC CCACCCAGCC CGACCGTCTT CGATAATTCC TACTTCAGAA ACATACTCTC CCGACGGGGG CTTCTCAGCT CCGACCAAGT TCTCTTCACT  CGCAGCGCAG CCACGCGGCG CCTGGTGCGC CTCTACGCTC GCAACCAAGC CGTCTTCCTC CGCCAGTTCG CGCAATCCAT GCTCAAGATG AGCTTAATTT CCCCCCTCAC TGGCAACATT 
GGGGAGATCA GGAGGAACTG CCGAAGGGTG AACGGATCTT AA 

Retrieve as FASTA