Entry information : LminPrx36(Lemmin6g0183780.t1)
Entry ID 18834
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx36(Lemmin6g0183780.t1)
Name LminPrx36(Lemmin6g0183780.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx36
start..stop
S start..stop
LminPrx10 657 0 1..333 1..333
LminPrx103 622 0 1..333 1..333
LminPrx85 621 0 1..333 1..333
LminPrx104 619 0 1..333 1..333
Literature and cross-references LminPrx36(Lemmin6g0183780.t1)
Protein sequence: LminPrx36(Lemmin6g0183780.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (311)
PWM (Da):   %s   36196.65 (34048.6)  
PI (pH):   %s   10.48 (10.73) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSCGVGAV LAVLTLGRIC EATQGSSSTV LYPQFYDRSC PRANEIVRSV VAQAVAREAR MAASLIRLHF HDCFVKGCDA SILLDSSRNI VSEKLSNPNR NSVRGFDVVD AIKTALEREC  PGTVSCADIL ALAARDSTVL SGGPTWEVPL GRRDSKRASL SGSNNNIPAP NNTLPTILTK FKLQRLNLVD LVALSGSHTI GMARCTSFKQ RLYNQTGNGQ PDSTLDASYA AQLRTRCPPS 
GGDNNLFFLD PPSPALFDNS YFRNILARRG LLSSDQILFT RSAASRRLVR LYARNQAVFL RQFAQSMIKM STISPLTGNR GEIRRNCRRV NGS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GACCATATGA GAGAGAGGGA GATAGAGGGA AATTACAAGA ATGCCATTTT GGCCCATATA CATTCACATG GAGCAACATT GTTGGTGAAC TTTTTTGGTA ACTATTTGTG TTCTCTCTTT  TGTTTACCCA TCCATTGACA TGAGGGGAGT ATTAGAACTA ATGAGTCGAT ATGTTTTTTC CCCATGTGTC AATGTATGCT ACTTAAGGGG AAATTCTACA TTTGGATTAG TTTGTTAAAT  TTTCTACCTT TTTAAGAATG AGTGGATTTC AATTTTTGGC CTTAGCATGA TGGGCTTTAT TATTAAAGTT CATTCATCAT CAATTTTCTA TCGTCATTCA AATTATGAGA TACCTCCAAA  AGAATAGAGA ATTTTGCATC CCATGGCAGC ATGCTATCAT TGCATATTTC CATAACTAAA TTCATGAATA GTTAGCACAA GTCTTACAAC CAAAATACTT AACCTCTACT ATTGCTTAAT  CCATTGAGAG AAAAAGTTGT CTTTCTCAAC TCCTGATAAA GGTATTACCC ACTTTATCAA GCTTATGGAT TTCAATTGAA ATGGCATACA AATCATCAAA TAATCTAGAA CTTGAACTCA  AATGCATTTG GATCCACAAG GCATCATAAC TTTTAAAGAA AAACCAAGAT GGTAATATAA TAAGAATATA TCTAATCAAC AGGCACACTT AGTCTAAATG TAATTGTATT TTGAGTTTGG  AAACCTTGCG GATGATAAGA TAGCACCTTG TGGAGCTGAA ACCAAAACAA ATCATTTAGT TTTTTAGTCT AAATCTTAAA AAAAATAGTT AGAACATCTA TATGTAATAT GTATACATCA  TTCTAAAACA GTATGTAACA TATATTAGAC AAATCATCAA GAATATTATA TCATTGTTTC CTTGCATCTT CAAAACAAAA AGGCAAACCA AAGAAGAGGA TTTATGCTCG AGGAGAGAGA  GATAGAGGGG GTGGAGTGTG ATTTAGGGTT TGGAGTTTTG GGGGCAGGGG CGAGAGGGCG GAGCGGTTTG GGCCCCAACC CACTCACTAA CTTAACCCGC TTGCTACACA AACCTGCGCG  AGATGGGAGG GCGGGTTGAG TAGTGGATGG GTGTTCAGGT ACAAGAAAAA ACAAAAAACA AAAAAACCTA ACTTTTAGGC TCTAAACTCT CAACTCTCTC TCTCCTCGAG CCTTGAGCCT  CAAGCCTATT TCCTTTTTTT TTTGGTTTTG CCTTTTTGTT TTGAAGATGC AAGGAAACAA TAATCTAATA TTCTTGATGA TTTGTCTACT GTATGTTACA TACTGTTTCA GAATGATGTA  CCCATACTAC ATATAGATGT TCTAACTGTT TGTTTAAAAG ATTTAGACAA TAAAACTAAG TGATTTGTTT TGGTTTCAGC TTCACAAGGT GTTATCTTAT CATCCATAAG GTTCCAGACC  GAATTCCCCT ATCCTCCCAA TCAGCCCCCT CACCTCTGCA AGTGGCTGTC ATGGCCTCCA GCAAACCACC ACTATCTGCA GAAAATGGCC ATCATCTAGT GCGAGTGAAG GGGAGAGAGA  GAGAGAGAGT AATATCGCCA AATGGTCCAT TAGTTAATGG GCCGAACACC CGCCCCACTC GAACCCTACT CGGTAGGTTC GAACCCTACC CGGCAGGTTT GAACGACTCA ACCCCGGGCT  TCCGAAGCCG AGTGTGATTT GAGCAGGTTA ATTACAGTTA ATATTCTCCA AAGGAAACTT TTAGGGTTTT TTATGATTTA AAATAGGTGT TAGTTTATGG GCCTAATGGA ACAAGGAAAA  CAACTCCTCT GTCCCTACAA ACTATAATCC TCTAATGGAG CAAGAAAATC AACTCCTCTG GAAGCAAAAG AACTATAAAT CCCCCCGGGA GCCAACACAT TGAGCATTGC CCTTCTCCCT 
CTCGTTCAAG GAAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCGAGAATG AAAGGACGGC GGGACAATAC TATGTTTATT TATTGAATCT AAGTGTTGGA TCAATCTTGA GTCAGATCGC TCTTCGTCGG ACTAAATCGT TTTTTTCTCT CTCCTCGTGT  AATCGTTTTT CTCTCTCCTC TCTCCTTGTG TAATCGTACG TCTTTGGGCC TTTTTGGTAT TGGGCCATCT GGGACATTTT AGCATAATAG ACGCTACCCT GATGGCGTAT TGCAGAGACT  CTCAAAGCCT CCTTCAATCA AAACTGTGTC TTTAGTCTTT TTTCAATTTG TTTTCTTCGC TTGGTTTCAG AGCGAGTTCT GATCCATTGT TTTGACGAAG AATGTCGAGG TGTTGAGAGG  GTTCTTCTCA CGATATGTTG GCTATGGCAA TAGCAAAGGG GATGGGTCGA CCGATGAATA TTGGCACCTT CCCCGTCCTC ACCAGAGCAA ATTACCATGT ATGGACGTCA TGAATTTGCT  TACATCTCAA AAGCCTTGAA CTCTGGGATG TGATTGAGGC ACATAATGCT CCAATGAAGA AGGATCAGCA GGTGATGTCG ATCATGTTCA GCAGGATCTC AAATGAGGTC AGGCATGAAC  TTGATGTTGA GAAGACCGCT ATTGAGACGT GGACAATCTT CAAGATTATA GGTGGAGGCG TGTCACGTTT GGTCAAGGCA AGAGTTCAAT CACTAATGAG GGAGTACAAG AATCTCTCCA  TGGAAGACGA CGAGGTAATC TTGGATTATT TTCGGAAACT TTCTTCCATT GTGATTGAAT TAAGGAGTCT CGGGGAAAAT TTAAGTGATG TCGATGTGTG TGTGAAATTG CTAAGATCAG  TCTCAGGCAG ATTTGATACT ATAACCACTT CTATATGACA ATTTGGATAC ATTCAGTCTT GATGATGTAA TCGGGACATT GAAATTACAT GAGGACAAGT TGAAAGAAAG GTCAATAAAG  AGAGAGGAGA AGGCTCTTTT GGCTAGAGCG CTTGGGAAGT CCAAGAATCA AGATCTTGAA TGCTCTAGGG GGGAAGAAGA GGAAGAGGCA AAGGCCGTGG TAAATGGAAA GAAAAACAAG  ATGAAGAGGA GACTAAATGC AAGCTTGCAA GAGATAAGTC AAAAGTTAAA TGTTATAATA GTCAAGGTAT GGGCCATTTT GCTAAATAAT GTCGACATCT AAAAAAAGAG AGACCAAAGA  AGAACAATTA TGACAAAGTC AATGTGGCTG AAGAGCAAGG CATAGAGACT TGTTTGCTTA TGGCGATTGA AGAAGGCGAT AAAGAGGTTC TTATACAAGG AATCTCCCAG ATCTATTTGA  GAAATGGTAT GTGGTATCTT GAAACCGGGG AAAGCATTTA TATGATAGGT GAGAGATAAC TTTTCTATGA TTTTGATGAA TCTTATAAAG GAAAAGTGAA ATTTGGAGAT GACTCTAAGA  TTGAAATTGA TGGCAGAGGG AAGATTATTC ATGATCCGCA TGACTGGCAG TTGACCAAAG ATCAAAGGAG CTCAAGAAGA TTATATCTAC TAAAATCAGA TAGAAGGGAA AGTTGCTTAT  ATGCCAGAGA TGATACAACC TGGACATGGC ACAAGAGGTA TTGAAATTTA AATTTTACCT CACTCTGTTC GTTCTCTACT TAGGATATGG TGAGAGGATT GCCCAAGATA GATAAGATTG  AGGATTTTAT GTAGAAAATA TGAGATCTCT AAACTGACCA GAGACTTAAT TCCATCATCT TCCACATTCA GAGACTATAG AGCTCTTCAA TTCACCCATA GGGATCTATA TGGGCCTATT  GAACGAGCAA CTCTGAGTGG CAGTAAGTAT TTCTTACTAA TCATTGATTT CTCTAGGTTG ATGTGGGGGA CGATGTTGAA GAGGAGATAT GATGCATTTG ATGCTTTAAA GAAATTCAAA 
GCAATTGTAA AAGCAAAGAA ATCACAAAAG ATCAGGTGTC TTAGGACTAA TCAAGGAGGA AAGTTCAACT CCACTAAATT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTCT CCTGTGGAGT CGGGGCGGTG TTAGCAGTCC TCACTTTGGG GAGGATCTGT GAGGCAACCC AAGGGAGCAG CAGCACTGTT CTCTATCCTC AGTTTTACGA CAGGTCCTGC  CCGAGGGCAA ATGAGATTGT CAGGTCCGTG GTGGCCCAGG CCGTAGCTCG AGAGGCTCGC ATGGCTGCCT CGCTCATCAG GCTGCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGT ATCTCCCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT ATCTATCTAT CTCTCTATCT TTCTATCTTT CTATTTATCT ATCTATCTAT CTATCTATTT ATCTATCTAT CTTTCTATCT ATCTATCCAT  CTATCTATCC ATCTATCTAT CTTTCTATCT TTCTATCTTT CTATCTATCT ATCTATCAAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT  CTATCTGCCT GTCCGTCTCC GGTTCCCAAG TCCTCAATCG GATGCGTATT ATGGTTAGGG TTGCGACGCG TCGATCCTGC TGGACAGCAG CCGCAACATC GTGAGCGAGA AGCTCTCCAA  CCCGAACCGT AACTCCGTGA GAGGGTTCGA CGTGGTGGAC GCGATCAAGA CAGCGCTAGA GAGAGAGTGT CCCGGCACGG TCTCTTGCGC CGATATTCTT GCCCTCGCGG CTCGAGACTC  CACAGTTCTC GTAAGCTTCA TCACAAGTCC ATTCTCCCAC CTTCTCTCTC CTCTCTCTAT CTCTCTCTAG ATTTTCCTGT TTAATCTCGC AGAGCGGCGG GCCTACCTGG GAGGTTCCGC  TGGGGCGGAG GGACTCAAAA CGCGCGAGCC TGAGCGGGTC GAACAACAAC ATACCCGCAC CGAACAACAC ACTCCCCACC ATCCTCACCA AGTTCAAGCT CCAGCGACTC AATCTCGTCG  ACCTCGTTGC TCTCTCAGGT ACTGCATCTT TAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GACAGAGAGA GAGAGTCCGG ACTTTTTGTT AATCTCTTTT TCTCCGAGTT TAGGGAGCCA TACGATCGGG  ATGGCGAGAT GTACCAGCTT CAAGCAAAGA CTGTACAACC AGACGGGGAA CGGGCAGCCC GACTCGACGC TGGACGCGTC CTACGCCGCG CAGCTGCGAA CGCGCTGCCC GCCCTCGGGC  GGGGACAACA ATCTCTTCTT TCTGGACCCG CCCAGCCCGG CACTCTTCGA TAATTCTTAC TTCAGAAACA TACTTGCCCG CCGAGGTCTT CTCAGCTCCG ATCAAATTCT CTTCACTCGC  AGCGCAGCCT CGCGGCGCCT CGTGCGCCTC TACGCTCGGA ACCAGGCCGT CTTCCTCCGC CAGTTCGCGC AATCCATGAT CAAGATGAGC ACCATTTCCC CTCTCACCGG CAACCGTGGG 
GAGATCAGGA GGAACTGCCG AAGGGTGAAC GGATCCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTTCT CCTGTGGAGT CGGGGCGGTG TTAGCAGTCC TCACTTTGGG GAGGATCTGT GAGGCAACCC AAGGGAGCAG CAGCACTGTT CTCTATCCTC AGTTTTACGA CAGGTCCTGC  CCGAGGGCAA ATGAGATTGT CAGGTCCGTG GTGGCCCAGG CCGTAGCTCG AGAGGCTCGC ATGGCTGCCT CGCTCATCAG GCTGCACTTT CACGATTGTT TTGTCAAGGG TTGCGACGCG  TCGATCCTGC TGGACAGCAG CCGCAACATC GTGAGCGAGA AGCTCTCCAA CCCGAACCGT AACTCCGTGA GAGGGTTCGA CGTGGTGGAC GCGATCAAGA CAGCGCTAGA GAGAGAGTGT  CCCGGCACGG TCTCTTGCGC CGATATTCTT GCCCTCGCGG CTCGAGACTC CACAGTTCTC AGCGGCGGGC CTACCTGGGA GGTTCCGCTG GGGCGGAGGG ACTCAAAACG CGCGAGCCTG  AGCGGGTCGA ACAACAACAT ACCCGCACCG AACAACACAC TCCCCACCAT CCTCACCAAG TTCAAGCTCC AGCGACTCAA TCTCGTCGAC CTCGTTGCTC TCTCAGGGAG CCATACGATC  GGGATGGCGA GATGTACCAG CTTCAAGCAA AGACTGTACA ACCAGACGGG GAACGGGCAG CCCGACTCGA CGCTGGACGC GTCCTACGCC GCGCAGCTGC GAACGCGCTG CCCGCCCTCG  GGCGGGGACA ACAATCTCTT CTTTCTGGAC CCGCCCAGCC CGGCACTCTT CGATAATTCT TACTTCAGAA ACATACTTGC CCGCCGAGGT CTTCTCAGCT CCGATCAAAT TCTCTTCACT  CGCAGCGCAG CCTCGCGGCG CCTCGTGCGC CTCTACGCTC GGAACCAGGC CGTCTTCCTC CGCCAGTTCG CGCAATCCAT GATCAAGATG AGCACCATTT CCCCTCTCAC CGGCAACCGT 
GGGGAGATCA GGAGGAACTG CCGAAGGGTG AACGGATCCT AG 

Retrieve as FASTA