Entry information : LminPrx60(Lemmin26g0582690.t1)
Entry ID 18858
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx60(Lemmin26g0582690.t1)
Name LminPrx60(Lemmin26g0582690.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx013]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx60
start..stop
S start..stop
LminPrx61 652 0 1..321 1..321
LminPrx88 570 0 23..321 12..310
SpolPrx42 523 0 25..321 25..321
NnPrx106 455 1.12e-162 15..321 19..325
Literature and cross-references LminPrx60(Lemmin26g0582690.t1)
Protein sequence: LminPrx60(Lemmin26g0582690.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (294)
PWM (Da):   %s   34138.88 (30984.3) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   7.85 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-321
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFVCRIRA EFCFLIFFFF FFAVASGQLS TTYYDSSCPK ALSTIQSAVK AAVSKERRMG ASLLRLHFHD CFVNGCDGSV LLDDTESMKG EKTAAPNDRS LRGFDVIDSI KSKVESVCPQ  VVSCADILAV AARDSVVALG GPSWTVQLGR RDSTSASLSS ANSDLPAPTS DLDTLISAFA KKGLSSSDLV ALSGSHTIGH ARCTTFRTRV YNESNIDSSL ATSKQSSCPR SGGDDRISPL 
DASTPCVFDG YYFKNLVGKK GLLHSDQELY NGGSTDSLVS DYAKNPAKFS TDFAAAMVKM GSIAPIFSPG GQVRVDCRKT N 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACCATCCTC TTATTACATT CTCTTAATCC AAATTTTTCT CTAAAAATCT CCTCCTATCA TCTAATCCTC TATATTAGTA TCTCCTCTTC TTCTTAGGAG ATTTAACGTC ACTGCCTAGG  CTCTCTGTGG TTCGACCCTT ACTTAAACCA TATACTATGT GAGGATTATA ATTTGTTTTT ATGAATTCAA TGCACAACGA CGACTAAAAT TAACACCAAA ATTGAGTTCA TCAACATGCG  CTAACGTGAG CTCGCACGCT CAATGCACCA TGGGCGTGCG CTAGCACATG CTGCGATTGC GCGCTGGCAC AAGCCTTGAG ATTGCGTTGA CTGCACATTG GTGCTCGCCA CGACTGTCTT  TTGGTTGCAC CTCAGCATGC GCTGCGGCAG CACATGTACT ACACTCCGGG CACACCCTAA CACCTATCAA AATTACCATT TTACTCCTCT TTTGATTTTT TTTCTTTCTT TGATTTTTTG  GGTCTCCTTT GATTTTGAGC TTCTTCAACC ACCTTTAACT TTGACTTTTA GATATTCTTA TTATTTTAAT TTACATCCAA ATTCTTCTTC ACATTGTCTT ATGCCCTTAC ATCCACAAAA  CTCATGAAAA ATGTGAGAAT TCAACCATTT GACCTCAAAT AATTCAAATA GGGTTAGTCT CAAAATATAG GTAAACAGGC AAGAATTGAT GCACGATAGG ACTTAATCAT ATTTCTAGAT  ATTTAAGCAT AAAATAATGA TATTCATACA AATAACCTTG TTAATTATTT CTTAAAGATA GTAAATGATG TATGTATGCA ACTATTATTT TATGGTTATC ACCTAGAGGG TAGGGTTACC  CTCTAAGCCG AGGTTTCCTT CCTAGTGGGC TGAAGTGGAC CATTGGGCGT GGGCCTCTAG TCTAATAGTT TTCAACTACT TGAGAAAGGA ATTACCCTCA ACCTAGAATA GTGGTGTTTT  TGTTTCACCC CTCTCGGTGA TTTAAGAATT TATTGCCTAA TTATTAGAGA ATAATTTTTC ATAGCGGGTA CTCTCTCTCT ATCCTCTTAT TCTTTCTCTC TCAAAGACTT CAGTCTTCAG  CTTCTAGAGG TGGTCTTCCA TGGCTCTTCA AAGCCATGTA TAGTAAGCCA GTAAAAGGAC CAAACAGTCC TCTCTGGCCG TTGTAATGGG TCTACTTCGC TTCTCTATGT GGAAGGAGGT  GGCATGAGCT TATCGTAGAT TAGTCGTTTC ATCTCGTAGA ACTAATGGAA TATGCTGGTT TGGCTTCCTC GTAACAGTTT ATCCATCATG CGATGCATGT TTCTTCTGTT TCTTATGTAG  GGTACCCAAG TCCCCTTCCA TTATCTACCT CCACTAACTG TAGACTACTA TGAGCTATGG ACGAGGCTTC TAGAAGTCTT CAATGCCTTT TACCTTCAGC ACTTAGTGAT AAAAGTGAAC  TCACCACCTA CTTCAAGAGA TCACCGAAGG CAAGCTCTTA CAGTGGAATA ACATACATAG GGTAAACATA TCTTCTCCCC CACTAAGCAC CTCACTGGAC CACGTTAAGT AAGAGTTGGC  TTTTAAATGG GAGGTGGCTC TGAAGGTTCC AAGTTAGGCA GGCTAGCATG CTTACATTAA AGAGGAATAC AAGAAGAAAA AGGGATTATA GAGGTGTTCC TGAGCTTTTT TGACTTGACA  GTGGATCGCC AAAAACAATA GGAAAGCGGA GAAGATTGGT ATCAAGGAGA TGGATTAAAC TTCATACTCA CAAGAAAAAG GGACTGATGG AGTCCATTTT TCTAGTGCCC ATCGCTGGGT  TTCCCTCTCC TGATCGCCCA TGACGAGGTT CGGTGGAATT AGCTCCGCAT TATTGCCTCT GTGTTGAGGA TGGACGGGCC CCAGCTTCCA TTGTTGAATG TCTCAAGCTT TTGACTATAG 
TCCAGAAGGC AAGCTCCAGA ACTTATATAA CTGCAAACTA CGTCTCTGCT CTTTCATCCT CCTTGAGCTC TTCTTCAGTA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCGTCTCAG AGAAGCCCCA GATCATCGTT GCCATAGACA TGTACCACCA TCCTACTGCG ACAAGAAAGT GTAGTGGCAT TGAATCAGGA CGAAATAGTA ATAAAATAAC AGGTGTTTAC  CCTTAGCATA AAATTGAATA TGGCTTTGGT TTGAGCAAAT AATGACCACC ATATCCTAAT TACATTGCTT TCATTCATGA TCTTAGTTAA TTAATTAATT AATTAATTTC TTCTGATAGC  CTTAAATAAA TACAATAAAA ATTTGCCCAA CGCCAGACAA GTTATACATA ACCTAACATG TTACTTGTAT ATGAAAATTG CCAATATTAA AATTATAATC ATGCGTAACT CATGAATTAT  CTTTTATAAT AATTAGAAAT TGTATTTATT TATACACTCA ATTTAATAGG ATAATGTTGG ATAGATAGTG AATCCAAGTC AGTCTTTAAG GAGTTTGTTG GATGTGGATC ACATTAGAAA  ATTAAGTATG TGAGTGGATT GGAATGTGGA TTAAAAAATG GAACACAAGT CAGAAGAATC ATCCCCTTAC TATTTGTTAA TAATAAATAT CAAAGACAAA AGAAGATTGT GAGTATATCT  GGGCCCGATA GACCAATGGC ATTTCTGTTC AACGCCTTGC CTCATACCGC ATCATATTGT CCTCTGGAAG CTGACTCTAA TCTCGGTGCG CATCAATTCC ACTCCTTGTG ATGGTTTACT  GTCTCCAATC ACAACACACC TTTCCACTTC GTGGGGGTTC ACCATCTAGG CATTCATATC TATCATGACA TCCATTTGGC CACGATGTTT GACTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCC CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CCCTCTTAGC TTCATTTTCA AGACTTAAGT GGATAATTAA TAAAGAAGAG AGAAGAAGAG AAAGATTTGA  ATAATCAAAG TCAACTTTGA GGGTTGGCTT AATTTGATTT TTTTAAGTCA AATTAGAACT CTTTAAGTTT ACCCATTTTT CTCTCTAACA TTTCCATTTC AAGTGGCATA GATTTAAAGA  AGACTAAATT TTTTATCTAA TAGTAAAAAT TTCACTCAAA AACGCATTTT ACATTAAAAG ATATAAATTT TTGAACTTAT CTTATTTTTC TGGATATTAT TTTATTTTTC AGGAAAATAA  AAAGGCCAGA AGGTAAGAAA TTGGTGTATG GGACCGCGAG GTGGCTTATG TAGCAGCACT GCCAAGTGGC AGCATGCTAG GGAGCCAGCG CAACAACACG GGCCCAGGCG AGAGCAGAGG  TGGCACCTGT GTGGCGCGCA CACGGTGTGC CCATGTGGCG CAAAGTGGAG ACAAGAGACA TTTGAGCCCA AAAAGGCATT CAAAGGTATA AGGGGCACTT AATAGATATC CTCCTTTATT  CTTTAGTTCT TTCCGATGTG GGACTCATCC CATTCTTTTT TATTGTAAGG ACACATGGCG GCGTGAAGAT TGTCGGATGC ATTGGATTAA ATGCACGACA TTGATCTGAT GGACCCATGG  TCCTTCAGAA CACTAAAGAA GCATGGGCTT TATTCGTGAT CGTCAATCTG GGTAAGTGAG ATCTGATGAC CAAGACTTAA TGGAGGAGAT GGCCATTGGG AGCATGACAC GTGGGCTACA  TCATGGACGT CGGATGGAGA TCTGATGGTG GAGATGAAAT CTGACCCATT CAAAGCCAAT TTTTTGCTTG ATCTAGACTA TCCAAGCCAG ATTTGACGGC CTAGATGGAT TCCAACCAAC  TCAAGAGCCT TTTCCACCTG ATCTGGGCCA TCCTTGTTAC ATTTGACAGC CCAGATTTAA TGCAACCCCT TCAATGGCCA CGCTTTGCCT AGTAAGGCCA AAAATGGCCA AAAATCGCCC 
AAAAATAGCC TAAACTCCTT AAATGCCCTA GACCCCTATT TAAACCCTTT CTTTCTCTCT CCTTTGATGT GTTTAGACGT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCT TCGTCTGTAG AATCAGAGCC GAGTTCTGCT TCCTCATCTT CTTCTTCTTC TTCTTCGCTG TAGCCTCAGG CCAGCTTTCT ACCACTTACT ACGACTCCTC CTGCCCCAAG  GCGCTTTCTA CAATCCAATC TGCGGTCAAA GCTGCGGTGT CAAAGGAACG CCGGATGGGG GCATCTCTTC TTCGTCTCCA CTTCCATGAC TGCTTCGTTA ATGCGAGTCC TCTGCCGGCA  AAGACTTCCA AATTTTGGAC AATGATGTGT TCGTTTCTAG TCGCTCTTCT TGAATTTGTT TTTTTTTTCT CATTTGATGG CAGGGATGCG ATGGATCAGT TCTCCTTGAC GACACAGAGA  GCATGAAGGG AGAGAAGACG GCAGCACCCA ACGACAGGTC TCTGCGTGGA TTCGACGTGA TTGACTCCAT AAAGTCTAAG GTGGAGAGCG TCTGCCCGCA AGTCGTCTCC TGTGCCGACA  TCCTCGCAGT CGCCGCTCGA GATTCAGTAG TCGCGGTAAG GAATCGCCCT TCATTTTCCT CGGCCACAAA AACCCTAATT CTCGTGAGTC GCAGTTAGGT GGGCCTTCGT GGACGGTGCA  GCTAGGAAGA AGAGATTCGA CTTCGGCCAG CCTGAGCAGC GCCAACAGCG ACCTCCCTGC GCCGACATCT GATCTCGACA CCCTCATATC TGCCTTTGCC AAGAAGGGTC TGTCATCGAG  TGACTTGGTC GCCTTATCAG GTACAAAACC CTAATTTATT AATTAAAAAA TAAACCTAAT TCCTCCCGCT TACTTCCAAA GGATCACACA CAATCGGGCA TGCAAGGTGC ACCACGTTTC  GCACCAGAGT ATACAACGAG AGCAACATCG ACTCCTCCTT GGCGACGTCA AAGCAGTCGA GCTGTCCTCG GTCGGGCGGC GATGACCGGA TCTCTCCTCT CGACGCCTCG ACGCCTTGCG  TTTTCGACGG GTATTATTTC AAGAACTTAG TGGGGAAAAA AGGCCTTCTC CACTCGGACC AGGAGCTCTA CAACGGGGGT TCCACGGATT CGCTGGTCAG CGACTACGCC AAGAACCCAG 
CAAAGTTCTC CACCGACTTT GCAGCCGCCA TGGTGAAGAT GGGGAGTATC GCCCCTATCT TTTCCCCCGG AGGGCAAGTC AGGGTCGACT GCAGGAAGAC CAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCT TCGTCTGTAG AATCAGAGCC GAGTTCTGCT TCCTCATCTT CTTCTTCTTC TTCTTCGCTG TAGCCTCAGG CCAGCTTTCT ACCACTTACT ACGACTCCTC CTGCCCCAAG  GCGCTTTCTA CAATCCAATC TGCGGTCAAA GCTGCGGTGT CAAAGGAACG CCGGATGGGG GCATCTCTTC TTCGTCTCCA CTTCCATGAC TGCTTCGTTA ATGGATGCGA TGGATCAGTT  CTCCTTGACG ACACAGAGAG CATGAAGGGA GAGAAGACGG CAGCACCCAA CGACAGGTCT CTGCGTGGAT TCGACGTGAT TGACTCCATA AAGTCTAAGG TGGAGAGCGT CTGCCCGCAA  GTCGTCTCCT GTGCCGACAT CCTCGCAGTC GCCGCTCGAG ATTCAGTAGT CGCGTTAGGT GGGCCTTCGT GGACGGTGCA GCTAGGAAGA AGAGATTCGA CTTCGGCCAG CCTGAGCAGC  GCCAACAGCG ACCTCCCTGC GCCGACATCT GATCTCGACA CCCTCATATC TGCCTTTGCC AAGAAGGGTC TGTCATCGAG TGACTTGGTC GCCTTATCAG GATCACACAC AATCGGGCAT  GCAAGGTGCA CCACGTTTCG CACCAGAGTA TACAACGAGA GCAACATCGA CTCCTCCTTG GCGACGTCAA AGCAGTCGAG CTGTCCTCGG TCGGGCGGCG ATGACCGGAT CTCTCCTCTC  GACGCCTCGA CGCCTTGCGT TTTCGACGGG TATTATTTCA AGAACTTAGT GGGGAAAAAA GGCCTTCTCC ACTCGGACCA GGAGCTCTAC AACGGGGGTT CCACGGATTC GCTGGTCAGC  GACTACGCCA AGAACCCAGC AAAGTTCTCC ACCGACTTTG CAGCCGCCAT GGTGAAGATG GGGAGTATCG CCCCTATCTT TTCCCCCGGA GGGCAAGTCA GGGTCGACTG CAGGAAGACC 
AACTGA 

Retrieve as FASTA