Entry information : LminPrx88(Lemmin39g0754230.t1)
Entry ID 18886
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx88(Lemmin39g0754230.t1)
Name LminPrx88(Lemmin39g0754230.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx013]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx88
start..stop
S start..stop
LminPrx61 570 0 12..310 23..321
LminPrx60 570 0 12..310 23..321
SpolPrx42 521 0 14..310 25..321
NnPrx106 457 9.32e-164 13..310 28..325
Literature and cross-references LminPrx88(Lemmin39g0754230.t1)
Protein sequence: LminPrx88(Lemmin39g0754230.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   310 (294)
PWM (Da):   %s   32592.08 (30759.2)  
PI (pH):   %s   7.65 (7.66) Peptide Signal:   %s   cut: 17 range:17-310
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFLYFFFF FAVASGQLSS TYYDSSCPKA LSTIQSAVKA AVSKERRMGA SLLRLHFHDC FVNGCDGSVL LDDTESAKGE KTAAPNDKSL RGFDVIDSIK SKVESFCPQV VSCADILAVA  ARDSVVALGG PSWTVQLGRR DSTSASLSGA NSDLPAPTSD LSTLISAFAK KGLSSSDLVA LSGSHTVGQA RCATFRARVY NESNIDSSMA TSKQSSCPLS GGDDRISPLD ASTPCVFDGY 
YFKNLVGKKG LLHSDQELYN GGSTDSLVSE YAKNPAKFST DFAAAMAKMG NIGPILSPSG EVRVNCRKTN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCAAATTCAC ACTCATTAGA TCCACTGCAT CTGATGCTCC AAAATGCACC ACATGGTTTC ATGAAAAGTT AAAGAAAGTT TAGTCCCACA TCAAAAGTTT GGATGACTTA AACACGGTAT  ATATTATAAG CTCGATTATT GGATTTGAAA ATCCATTGGC CACTATGTGC TTATTGGATC CTCGTGCCAC CTATATCCAA CTGAGTGTCA TGCTGGCGAC ACGTGTACAT CCGCATTTAT  ACAGTGGCTT GCTGGTGCAT TTTCATATGA TGGTGCAGCC ACATCAGCTG GTGTCATGGA TCCACACACC TATTTTTCTC TTTTCCCCCT TTTAATCCTT GAAAAATATC AAAAACTCCA  AAAAATACAT TTTAACTTTA AAAAGTTAAA TTTCTAAATA TACGACTCAT TTTTTAATGA AATTTTCACG ACTAGATTCA AGAGTTTAAG TCTTTAATTC CTTGTATCTT GAAACACAAA  CTAAGACAAC AAGTTTTAGT TTGGGAAAAA CATTGGTTTG ATTTAGAACG TCAAACTAGC TCAACTATAA CAGATGACTT GATTTTCTTT TACTCTTCAT TTATATTATT GCTTCTAAAT  GCTATTTCCC TTCACAAGTC ACTAGAATTC TGTTTTATTT GGAGTCACTA CCTAAACTAG TTTCTTCAGC ATTTTCCACC AGGATATTGG TGACAAAAAA TTGAATAAAG GGAAATGACA  AAAAATATCG CCAAGAATGA TATTGGTGAT GTACAAGGAC TTCACATAGT TCCATGTTCT TTTGTTTCTA GGGCCTAGGT TACCTGATAG TCTGAAGCAA ACCATATGCC TTTAGTCTAA  TTTTTTTTAA AAATTATCTC CTTCTCCCCT CCTCAGCCTC ATTATTTAGT CACAATGTCA TATTTTTAGC ATTCACAATA TTTCCTTTTA TGAATTTTAC TTATTATGAT TTCTCATATC  TATCTTAGTA GACATGCAGA ACCAGTGCTA TGTGTCGACT ATCTAGTCGT CCCACACCAC AGCCATATAC TAGGTGGAGA CTCCACTACC GTGACGCCTT TTTATGTTTT GCTTAATTTA  GAAATTGTGG AATGCACATT CGTCGCCACC AGAACAAAAG CCGGATGGAT GTATTTTCCA CCATACAAAT CCTAGTGTTT GGCTTCTAGG CTAAATCACA CTTGATATGG TGTTCATCTA  CTTGACAAAA AGGAAATACC CTCAACCTAA AATAGTGTTG ATTTTTGTCT CATCCCTCTT AGTGATTTAA GACTTTCTTA CTTACAAATT AGTGAATAAT TTTTTCTCTC TATCCTCTAA  TTCTTTCTCT CTTAAAGACT TGGTTCTTGA ACTTCTCAAG GTAGTCTTCC ATGGCTTATG AAAGCCACTG ACAGCAAGCC AGTGAAAGGA CCAAACATTC TTCTCTAGTC CTTGGAAGGA  GTTGGCTTCA GCTTAACCTA ATTTTCTTTC AATCTCTTGG AACAGATGGT ATATGCTGAT TTGGTTTCTG GGGTGGCTTC CTCATAACAG TTTATCCCTC ATGATACCTG TTTCTTCTGT  AGGGCACCCA AGTCCCCTTC CATTATCTAC CTCCACTAAG GGTAAACATA TCTTCTCCCC CCACTAAGCA CCTCACTGGA CCACGTTAAG AAAGAGTTGG CTTTTCTATG GGAGGTGGCT  CTGAATGCTC CAAGTTAGGC AGGCCAAGAA GATTGACATC AAGGAGATAG ATTAAACTCC ATACCCACAA GAAAAAGGGA CTGCTGGAGT CCATTTTTCT AGTGCCCATC GCTGGGTTTC  CCTCTCCTGA TCGCCCATGG TGGGGTTTGG TGGAATTAGC TCGGTGTTGA GGATGGAGGG GCCCGGCTTC CATTTTTGTA TCTCTCGAGC TTTGACTATG GCGGGAAGTT CTTGGCTTAG 
TCCTGAAGGC GAGCTCCAGA ACTTATATAA CTACGAACTG CGTTCCTGCT CTTTCATCCT CCTCGAGCTC TTCTTCAGTA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCATCTCGG AGAAGCCCAA GATCATGGTT GCCCTAGTAA TAAAAAATAG GTGTTTCCCC TTAGCATAAA ATTGAAAAAG GCATTGGTTT GAGCAAATAA TTACCACCAT ATCCTAATTA  CATTGCTTTC ATTTATGATC TTAATTAATT AATCCTTAAA ATAAGTACTA TCAAAAATTG CCCAACTTGA GAAACTTAAA GTTGCATTTT TATTATCCAA GGCATACCAA GCAACCTTCT  CCATCTCCAA ACCACGGAAT ATCAAACCAA CCTTGTCTCG TTACAGGCGA CCAATCTAGC TAAATTTCAC ATATATCAAT AAAATATGAA ATAATTGCCT ACAAATGTAT CTCATGGAAA  TTGCGCTGAG CACAATTCAA ATATGTGCAT GAGTAACTTA TCAAACTTTG TACAAGATAC TGATCAGATG TATTCAGTGA AAGTACCAAG CTCAAGTTGT ATTCCTACTA TAATTATTTG  CACACGTGTC CCTAAAAATA TCAGCCAAAA TTTAAGTTAT ATGTATCCTC GCATGTCACC CGTACATGAA AGATGCCCAC ATAAAAAGTT ATGATCATGC ATAAATCATT AATTATATTT  TTTAATAATG ATCAATTGTA TTTATTTATA CACTCAATTT AGAAGGATAA TGGTGGATAG ATAGTGAATC CTAGCCAGTC TTTAAGGAGT TTGATCGATG TGGATCACAT TAGAAAAGTG  AGTATGTGAG TGGATTGGAA TGTGGATTAC CCAATGGAAC ACAAGGGAGT TAGAAAAATC ATCCTACTAC AATTTGTTAA TAATAAATAG CAAAAACAAA AGAAGATTGT GAGTATATCT  AGTACCAATG GGCCAGTGGC ATTTTTGTAA TTCTCTTTTA CTTCTATCTT TTTTTTGTAG GGTCACATCC TCACTATATA AAGGGATATC ATCCCCCTCT TATTTTCTTA AACTACTATA  TTCTATAAAG TTCTACATGG TATCAAAGCC CTCATTGTCT CTAGGGTTTC CTCCTGGCTA TGGCAGCTGC GGTGTTCTTT GTCGTGTCTT GTCACTCTCT ATCTTCTATC CTTCCTTCTC  CGACTTTTTC ATTGGTCTCT CCCTCGACAG CATCCTCTTC TTGGCATCTA GGGTTTCCTC CATGTGTGTC GTAGCGCCTC CTTTGAATGC TAGATCACTA CATGTGGATC CCTTTAGCGT  AGTGACCTGC CACACCACAC CCTATCGTGT TGCGTCCGAC AATGCTTAGT CTTGCCCTAC AAAGGCGTGT GCCGCCTCCC ATCCCTATTG CAGCGTGTGA TGCCACCTTG TCTTACAGTA  ATGAGTATTT CTGCCCTGCC TACAGTTGCG CTCCGCCCTG CCTTCAATTG TGTCATGCTG TCCTCCACCC GCTGACTCTT TTTTTGATGC ATGCTGGTTC CGCTCCTCGT GATGGTTTAC  TATCTCCAAT CGCAGCACGC CTCTCCACTT CATGGCGGTT CACTGTCTGG GTATTCATAT CTATTTGGCC ATGACACTTT TTCTTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC  TCTCTCTCTC TCTCTCCCCC TCTCCCCCTC CAACCTCTTT GTGAGTGAAT ATGTATCATC TAGTGGCATT TCTGTAATTC TGTAGACATT ATCTCTCTCT CATATGGTCC CTCCTCACTA  TATAAGAGGA GGCACCCCCC CCTTCTGAAA TTAATCGATT ACATCAGTTT CTATTTCCAC ATGGTATCAG AGCCCTAGGG TTTCCGTGGC GGAGGCCGCT CCGAAGAGTC GCCGCCGCCT  TACGCTCCGC CTCCTCTCCA TCATCAACGG CGCCGGTCGC CCTCTACTGC CTCTCGGACC CATTGCAACG CCCGCGGAGG TATTACCTCG TGATCCCCCC GCCCGCGCAG GTGGAATCAT 
GTACTTGCGT GTGTTCACAC CTTGCGCCCC CCATCTTCCT ATACTTGCGT GCGTTCACTC CTTGTCCCCC CCCCCCACGA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCT TTCTCTACTT CTTCTTCTTC TTCGCTGTGG CCTCAGGCCA GCTTTCCTCC ACTTACTACG ACTCCTCCTG CCCCAAGGCG CTTTCCACAA TCCAATCTGC GGTCAAAGCT  GCAGTGTCAA AGGAACGCCG GATGGGGGCA TCTCTTCTTC GTCTCCACTT CCATGACTGC TTCGTCAATG CAAGTCCTCT GCTGGCAAAG ACTTCCAAAT TTTGTTCGTT TCTAGTTGTT  CTTCTTCAAT CTGTGTTTTC TCTTCTGTTA ATGGCAGGGA TGCGATGGAT CAGTCCTCCT CGACGACACA GAGAGCGCGA AGGGAGAGAA GACGGCAGCA CCCAACGACA AATCTCTGCG  TGGATTCGAC GTGATCGACT CTATCAAGTC CAAGGTGGAG AGCTTCTGCC CGCAAGTCGT CTCCTGCGCC GACATCCTCG CAGTCGCCGC TCGAGATTCC GTGGTCGCTG TAAGGAATCG  CCCTTCGTTC TCCTCCGCGA CAAAAACCCT AATTCTCGTG AGTCGCAGTT AGGCGGGCCT TCGTGGACGG TGCAGCTAGG AAGAAGAGAT TCGACCTCGG CCAGCCTGAG CGGCGCCAAC  AGCGACCTCC CTGCGCCGAC TTCCGATCTC AGCACCCTCA TTTCTGCCTT CGCCAAGAAG GGTCTATCGT CTAGTGACCT GGTCGCCTTA TCAGGTACAA AACCCTAATC CATTACTTCA  AAAAATAAAC CCTAATTCCT CCCGCTTGCT TCCAAAGGAT CACACACAGT CGGGCAGGCA AGGTGCGCGA CGTTCCGCGC CAGAGTATAC AACGAGAGCA ACATCGACTC CTCCATGGCA  ACGTCGAAGC AGTCGAGCTG TCCTCTGTCG GGCGGCGACG ACCGGATTTC TCCTCTCGAC GCTTCGACGC CCTGCGTTTT CGACGGGTAT TACTTCAAGA ACTTGGTGGG GAAAAAAGGC  CTTCTCCACT CGGACCAGGA GCTCTACAAT GGGGGATCCA CAGATTCACT GGTCAGCGAG TACGCCAAGA ACCCGGCGAA GTTCTCCACT GACTTTGCAG CTGCCATGGC GAAGATGGGG 
AATATCGGCC CTATCTTGTC TCCCAGCGGG GAAGTCAGGG TTAACTGCAG GAAGACCAAC TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCT TTCTCTACTT CTTCTTCTTC TTCGCTGTGG CCTCAGGCCA GCTTTCCTCC ACTTACTACG ACTCCTCCTG CCCCAAGGCG CTTTCCACAA TCCAATCTGC GGTCAAAGCT  GCAGTGTCAA AGGAACGCCG GATGGGGGCA TCTCTTCTTC GTCTCCACTT CCATGACTGC TTCGTCAATG GATGCGATGG ATCAGTCCTC CTCGACGACA CAGAGAGCGC GAAGGGAGAG  AAGACGGCAG CACCCAACGA CAAATCTCTG CGTGGATTCG ACGTGATCGA CTCTATCAAG TCCAAGGTGG AGAGCTTCTG CCCGCAAGTC GTCTCCTGCG CCGACATCCT CGCAGTCGCC  GCTCGAGATT CCGTGGTCGC TTTAGGCGGG CCTTCGTGGA CGGTGCAGCT AGGAAGAAGA GATTCGACCT CGGCCAGCCT GAGCGGCGCC AACAGCGACC TCCCTGCGCC GACTTCCGAT  CTCAGCACCC TCATTTCTGC CTTCGCCAAG AAGGGTCTAT CGTCTAGTGA CCTGGTCGCC TTATCAGGAT CACACACAGT CGGGCAGGCA AGGTGCGCGA CGTTCCGCGC CAGAGTATAC  AACGAGAGCA ACATCGACTC CTCCATGGCA ACGTCGAAGC AGTCGAGCTG TCCTCTGTCG GGCGGCGACG ACCGGATTTC TCCTCTCGAC GCTTCGACGC CCTGCGTTTT CGACGGGTAT  TACTTCAAGA ACTTGGTGGG GAAAAAAGGC CTTCTCCACT CGGACCAGGA GCTCTACAAT GGGGGATCCA CAGATTCACT GGTCAGCGAG TACGCCAAGA ACCCGGCGAA GTTCTCCACT 
GACTTTGCAG CTGCCATGGC GAAGATGGGG AATATCGGCC CTATCTTGTC TCCCAGCGGG GAAGTCAGGG TTAACTGCAG GAAGACCAAC TGA 

Retrieve as FASTA