Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
355 (328) |
PWM (Da): |
38575.55 (35764.1) |
Transmb domain: |
i7-29o |
PI (pH): |
8.41 (8.39) |
Peptide Signal: |
cut: 28 range:28-355 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MNSFRVIVTALCCVVVVFGGLPFSSNAQLDPYFYGKTCPKLHSIA FKVLRKVAKTDPRMPASIIRLHFHDCFVQGCDASVLLNNTATIVSEQDAFPNINSLRGLDVINQIKTKVEKACPNRVSCADILTLASGISSVLTGGPGWEVPLGRRDSLTANQSLANQNLPGPNFSLDRLKSAFAAQGLNTVDLVALSG AHTFGRARCLFILDRLYNFNNTGKPDPTLDTTYLQQLRNQCPQNGTGNNRVNFDPTTPDTLDKNFYNNLQGKKGLLQSDQELFSTPGADTISIVNSFANSQNVFFQNFINSMIKMGNIDV LTGKKGEIRKQCNFINKKSSELDLGIVASAESMEGDMVSSI |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from 33 ESTs and genomic (chromo 2, 3 introns). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAACTCATTTCGTGTCATTGTAACAGCTTTGTGCTGTGTAGTGGTTGTGTTTGGAGGACTACCCTTCTCTTCAAATGCACAACTTGATCCATACTTTTATGGCAAAACTTGTCCCAAA TTGCATTCTATAGCATTTAAAGTCTTGCGGAAAGTTGCTAAGACGGATCCCCGAATGCCTGCCAGTATCATCAGGCTTCATTTTCATGATTGTTTCGTTCAAAAGTATGTTTCTATTATT ATGCTTTGCTGTAGTATTTATCATTCACCCCCCAGTTATATATTTGTTAGCATGTGTTGAAAAATACTTTAGGGTTCCACATCTGAAAAATCAAGACAATTAAAAGTGCATACATAACCA TAAAAGGAGTTGACTGAATTCGATTTATGGGCAATACATTTCTTATGCATGTACTTCCTTATTATTATTTTTTGGCTCTAAAAAAATAACACTAACCAACAATATATGTAGGGTTGGTCT AAAGGTAAGACTACTAAAACCTTTGTCTAGGCCCTTTCTTGTTAATTTAATAATTGTCATATTTGCCAAAGATTAATAGTGTCATTACTAGTTAATTTTCAACATAATTTTAATGGATTT ATTTATTTATTTTACTATCTAACTAATAATATTCTCAAGTTATTATTTTATGATAATTAAAATTAGTCAATAGTTTATAAAGTTAATTTAATAAAAAAATTATTCTCTTTCTTTTACTTA TAATACCTTCTCTCTAATTTATGGGACATAATATGACAATTTTTTATTATCATATATGTATATATGTAGTTTTTGAGATAGAGCACTAAATAACTTGATATTATTTATGATTGAAACAGG GTTGTGATGCATCAGTTTTGTTGAATAACACCGCAACTATTGTGAGTGAACAAGATGCTTTTCCAAATATCAACTCCTTAAGAGGATTGGATGTTATCAATCAAATCAAGACTAAAGTGG AAAAAGCTTGCCCTAATAGAGTTTCTTGTGCTGATATTCTTACACTTGCGTCTGGAATATCTTCTGTTCTGTGGTACATATTTTTAGTTTCAAGTATTTTCCTATACAACTATACTTTTT CTTTTTTTGGTAGAATACATATATACATTTTATTTTAATTAGTTAAAATATTATTACTTCTTTAATTTTATTCATTGTATGATCTTAAAATAATACAATCAATCTATTTACACAGACTGG GGGTCCAGGTTGGGAGGTTCCACTAGGAAGAAGGGATAGTCTAACAGCAAATCAATCCCTTGCCAATCAAAATCTTCCAGGTCCCAACTTCAGTCTAGATCGACTTAAATCTGCCTTTGC TGCTCAAGGACTTAACACGGTTGACCTAGTAGCACTCTCAGAGGTATATATATACATGCACCATTTTCTAAATGTTATCTATAATGATAACAATATAATTTTTTATCCAACAGTGATATT TAGATAATATTACCATGAATTTTTTATCATAACAAAGATTTCGAATTTGGATATGATCAATGAACCATATTATTATTAAAACTTCAAATTGTTGAGGAGAGTTGTCAACGCTTTAGACTT GATGAATAGTCTATGGAGGTGTGGGTTACTCAATTATAAAAAATAAAAAAAATTAGAAAATTAATTTTAAAATCAGTTGACTTTTGAATAACTTGACCATTAAAAAAAGATAAATGTCAT ACATCAAGATCATTGCCTAATAAGTCGACGAGGACAAAAAAAAAATCTCCTTAACTGTAAATTCATAGGGAAATGCTCTAGAAGTGACCGAAAGATAAGTAAATTTTAGTTAAGAATTGT TTGATTTATGATTCGAACTTGTATTTTTTTTAGAAAAATTTCGTGATTACAAACACTTTCTCGTAAAACAGTTATGTTGCCACGTCTTTAAATATGATCTCCTTAACTAAACTACTTCAA CTTCAGGTGCTCATACATTTGGGAGAGCACGTTGCCTTTTCATCCTTGATCGATTATACAACTTCAACAATACTGGCAAACCCGATCCAACTCTTGATACAACATACTTACAACAGTTGC GAAACCAATGCCCTCAGAATGGAACTGGAAATAACCGTGTTAATTTCGACCCAACGACTCCTGATACATTGGACAAGAACTTCTACAACAATCTTCAAGGTAAAAAGGGTTTGCTTCAAA GTGACCAAGAATTATTCTCAACACCGGGTGCAGATACCATTAGCATTGTCAACAGCTTTGCAAATAGCCAAAATGTTTTCTTTCAGAACTTTATAAATTCAATGATTAAAATGGGTAATA TTGATGTGCTTACCGGAAAGAAAGGAGAAATTAGAAAACAATGCAATTTTATTAACAAGAAATCTTCTGAATTGGATCTTGGCATTGTGGCCTCTGCAGAATCAATGGAAGGGGATATGG TTAGTTCAATCTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAACTCATTTCGTGTCATTGTAACAGCTTTGTGCTGTGTAGTGGTTGTGTTTGGAGGACTACCCTTCTCTTCAAATGCACAACTTGATCCATACTTTTATGGCAAAACTTGTCCCAAA TTGCATTCTATAGCATTTAAAGTCTTGCGGAAAGTTGCTAAGACGGATCCCCGAATGCCTGCCAGTATCATCAGGCTTCATTTTCATGATTGTTTCGTTCAAGGTTGTGATGCATCAGTT TTGTTGAATAACACCGCAACTATTGTGAGTGAACAAGATGCTTTTCCAAATATCAACTCCTTAAGAGGATTGGATGTTATCAATCAAATCAAGACTAAAGTGGAAAAAGCTTGCCCTAAT AGAGTTTCTTGTGCTGATATTCTTACACTTGCGTCTGGAATATCTTCTGTTCTGACTGGGGGTCCAGGTTGGGAGGTTCCACTAGGAAGAAGGGATAGTCTAACAGCAAATCAATCCCTT GCCAATCAAAATCTTCCAGGTCCCAACTTCAGTCTAGATCGACTTAAATCTGCCTTTGCTGCTCAAGGACTTAACACGGTTGACCTAGTAGCACTCTCAGGTGCTCATACATTTGGGAGA GCACGTTGCCTTTTCATCCTTGATCGATTATACAACTTCAACAATACTGGCAAACCCGATCCAACTCTTGATACAACATACTTACAACAGTTGCGAAACCAATGCCCTCAGAATGGAACT GGAAATAACCGTGTTAATTTCGACCCAACGACTCCTGATACATTGGACAAGAACTTCTACAACAATCTTCAAGGTAAAAAGGGTTTGCTTCAAAGTGACCAAGAATTATTCTCAACACCG GGTGCAGATACCATTAGCATTGTCAACAGCTTTGCAAATAGCCAAAATGTTTTCTTTCAGAACTTTATAAATTCAATGATTAAAATGGGTAATATTGATGTGCTTACCGGAAAGAAAGGA GAAATTAGAAAACAATGCAATTTTATTAACAAGAAATCTTCTGAATTGGATCTTGGCATTGTGGCCTCTGCAGAATCAATGGAAGGGGATATGGTTAGTTCAATCTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGACAGAAAC TTCAAACACA ATTCTAATAT CATTTAGGGG TAACAATGAA CTCATTTCGT GTCATTGTAA CAGCTTTGTG CTGTGTAGTG GTTGTGTTTG GAGGACTACC CTTCTCTTCA
AATGCACAAC TTGATCCATA CTTTTATGGC AAAACTTGTC CCAAATTGCA TTCTATAGCA TTTAAAGTCT TGCGGAAAGT TGCTAAGACG GATCCCCGAA TGCCTGCCAG TATCATCAGG
CTTCATTTTC ATGATTGTTT CGTTCAAGGT TGTGATGCAT CAGTTTTGTT GAATAACACC GCAACTATTG TGAGTGAACA AGATGCTTTT CCAAATATCA ACTCCTTAAG AGGATTGGAT
GTTATCAATC AAATCAAGAC TAAAGTGGAA AAAGCTTGCC CTAATAGAGT TTCTTGTGCT GATATTCTTA CACTTGCGTC TGGAATATCT TCTGTTCTGA CTGGGGGTCC AGGTTGGGAG
GTTCCACTAG GAAGAAGGGA TAGTCTAACA GCAAATCAAT CCCTTGCCAA TCAAAATCTT CCAGGTCCCA ACTTCAGTCT AGATCGACTT AAATCTGCCT TTGCTGCTCA AGGACTTAAC
ACGGTTGACC TAGTAGCACT CTCAGGTGCT CATACATTTG GGAGAGCACG TTGCCTTTTC ATCCTTGATC GATTATACAA CTTCAACAAT ACTGGCAAAC CCGATCCAAC TCTTGATACA
ACATACTTAC AACAGTTGCG AAACCAATGC CCTCAGAATG GAACTGGAAA TAACCGTGTT AATTTCGACC CAACGACTCC TGATACATTG GACAAGAACT TCTACAACAA TCTTCAAGGT
AAAAAGGGTT TGCTTCAAAG TGACCAAGAA TTATTCTCAA CACCGGGTGC AGATACCATT AGCATTGTCA ACAGCTTTGC AAATAGCCAA AATGTTTTCT TTCAGAACTT TATAAATTCA
ATGATTAAAA TGGGTAATAT TGATGTGCTT ACCGGAAAGA AAGGAGAAAT TAGAAAACAA TGCAATTTTA TTAACAAGAA ATCTTCTGAA TTGGATCTTG GCATTGTGGC CTCTGCAGAA
TCAATGGAAG GGGATATGGT TAGTTCAATC TAAATGAATG TGGGTTACTT TAGATGAAAT GTGGTGATTG GAATTCACTA ATAAAGAGAA GTGCTGGCTA AGCACATTTG TGTCATGAGG
TATACTGTAT TTTACGTGTT TTATGTGTGT AAGATAACCT TCTTTCAATG TAATTTTCAT TATAAAATCC TTTC
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Retrieve as FASTA
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