Entry information : PpaAPx-R (Pp1s277_34V6.1 / PP00277G00190 / PP00277G00200)
| Entry ID | 5761 |
|---|---|
| Creation | 2010-02-10 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-07-03 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Nizar Fawal |
| Last annotation changes | 2012-03-12 (Nizar Fawal) |
Peroxidase information: PpaAPx-R (Pp1s277_34V6.1 / PP00277G00190 / PP00277G00200)
| Name (synonym) | PpaAPx-R (Pp1s277_34V6.1 / PP00277G00190 / PP00277G00200) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase related [Orthogroup: APx-R001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Physcomitrella patens [TaxId: 3218 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | Gamete |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5761' 'complement(join(194117..194225,194436..194511,194627..194748,194864..194947,195204..195300,195448..195490,195927..195997,196213..196340,196561..196672,197353..197433,197755..197905))' |
Exons►
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Literature and cross-references PpaAPx-R (Pp1s277_34V6.1 / PP00277G00190 / PP00277G00200)
| Literature | Kuroki,Y., Toyoda,A., Sakaki,Y., Tanahashi,T., Nishiyama,T., Hiwatashi,Y., Suzuki,Y., Sugano,S., Fujiyama,A. and Hasebe,M. Evolution of developmental genes in land plants. |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_277 (197905..194117) |
| mRNA ref. | JGI transcript: 95278 [5' end] 148437 [3' end] |
| EST ref. | GenBank: BY946235.1 [5' end] DC949475.1 [3' end] |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Ppa.8172 |
Protein sequence: PpaAPx-R (Pp1s277_34V6.1 / PP00277G00190 / PP00277G00200)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and 7 ESTs. Strain="Gransden2004". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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