Entry information : PcLDS01
| Entry ID | 6649 |
|---|---|
| Creation | 2009-03-29 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-03-28 (Catherine Mathe (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-12-23 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PcLDS01
| Name | PcLDS01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6649' 'complement(join(25487..25507,25576..25672,25726..25805,25924..26422,26475..26560,26611..27291,27343..27376,27462..27526,27581..27714,27767..27801,27855..28321,28377..28486,28540..28695,28745..29008,29061..29208,29258..29407))' |
Exons►
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Literature and cross-references PcLDS01
| Literature | Martinez,D., Larrondo,L.F., Putnam,N., Sollewijn Gelpke,M.D., Huang,K., Chapman,J., Helfenbein,K.G., Ramaiya,P., Detter,J.C., Larimer,F., Coutinho,P.M., Henrissat,B., Berka,R., Cullen,D. and Rokhsar,D. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nat. Biotechnol. 22 (6), 695-700 (2004) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_31 (29407..25487) |
Protein sequence: PcLDS01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (17 introns) and 1 EST (DV759138). Strain="RP-78". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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