Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
229 |
PWM (Da): |
24741.86 |
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PI (pH): |
5.11 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
RPGTKEYLLIKEEVRKVLSKGKAAGVLRLVFLDAGTFDIDDSTGIILLVLQQAKTQIDVIQPNILLSVSWADMNIAVAGAEAVEVCGGPPIQVSPGRLDTLVHDPEGRLPEESLNASGLK KCFQSKGFLTQELVALSGAHTIGSKGFGSSISFENSYYKVLLEKPWTSGGMSSMIGLPSDHALVEDDECLRWIKKYADSENLFFEDFKNAYVKLVNSGVGGIAYKFR |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Pseudogene from genomic (chromo 4). 2 first exons, fragments (xxx) and stop codon are missing. ORF predicted by Phytozome. No EST. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
AGGCCAGGTACAAAGGAATATCTTCTCATTAAAGAAGAGGTGAGGAAGGTCTTGTCAAAGGGAAAGGCTGCTGGCGTGCTTCGATTGGTTTTCCTCGATGCCGGAACCTTTGACATCGAT GACAGTACAGGTATAATACTTTTATATCTCATCTGAGGGACTCCAAGTTTCTGTTTTTTTTCAATTTTCACAGTCCTTCTGCCTTTCTAGCAAAAGCCAATGGAATTTGGCTCTCTTGTA AAATGAAAGTAAATCAATTGTTTGAAATGGTTTGACATCATCACGGTTGAAAATCAGTAAAGGCATGCTCTGTCTCACTATTTTCTCGTTTCCCTTCTGTCACCTCTCTTTCTAGTACTA TTTGAAGATCATTAAGACAAATATCTTACATTTTAACTGCCAGCTAATATCTCAGTGGACGTATCACATATTTTTTAGGTTCTGCAACAAGCAAAGACTCAGATAGATGTTATCCAACCA AATATTCTTCTATCTGTGGTAACTGCTGCTAATGGTAAGCGATAATTTGGTCCAGACCAACAAATTTTTGCTTATCTTTATTAGTATCTTGGGCGGACATGAATATTGCTGTGGCTGGAG CTGAAGCAGTTGAAGTATGTGGAGGTCCACCTATCCAAGTTTCACCGGGTAGATTAGATACATTTTGTAAGATGCTTGGTTTCTGGTTGACATGTTCTCGAGTTAGTACGTATGACGTGA CAAGAAACTGGTTTTTCTTAACAGGATGACAAACAAGCAGTTATATGTTAGTTTTGGTGCATTAGGTTCTGTGAAAATGTTTTTTAACCAATTACTGAATTTTGTCCAATCTGTTGTTTA ATGAATGATCAACCATTTTGCAGAGAAAAAAAAAAATCCTCCATGGGAACTTAACTCATTGGTTTTCGCATAACACATGAAATCTGGTTTTGTCTTCAGTCAGATGCTATTTGCATTCAT TTTAATGATAGGGTGCATGATCCAGAAGGGAGACTTCCTGAGGAATCTCTCAATGCTTCTGGTTTGAAGAAATGTTTCCAGAGCAAAGGCTTTTTTTGTGAGTATGAGAACAACACCTAT TTTATAGTTTAGACTAGTGCAGCTATACATCATCTAGAAGCTGTCTGATTGTCCATAACTTAACATGAGAATCTTAACATTACAGAAGCAAGAAATATTGTGATAAAGTCCCGATTCTAA ACCAGACTAACAAGGCAAGAAATATTGTGATTTACTGACCAAAAAATCACTGGTAATAAGCTTATTAGTTATTGTTTAAAATTTTCAACGTATTTTACTTGAATTAGTTTTGCTTATGCA TCCTTATCATTTGGAGCTTTTCTTTTATAGAACACAAGAACTTGTGGCTTTGTCTGGAGCCCACACTATTGGAAGTAAAGGTTTTGGAAGCTCAATTTCTTTTGAAAATTCATATTATAA GGTTCTTTTGGAGAAGCCCTGGACGTCTTCAGAGGTAAGTTAACAGCTTATTTCATCTAAACATCGTTTTTATATTTTTTGTAAACTTGCTGCCAATCATTGTTTTCTGAAGCAGTTCTC TTAGAACAAAAACAACAAGGAAATGAATACCAAAAAAAAAAAAAAAGGAAATGCAGGAGTTGAATGCATGTCACTATGTTAAGCTTAGCCACTAGATTATCACATAATTTATGTCCAGTC TGCTCTGGATCTTAATGTTCCAATCAAGTTTTTCAGTTTCTTTGCCATCAGTTGTGCCTTCCAATAAACTACTATAAATGACATTAATATCTGGTATAGCGGCTCAAGTGGGTTAATGCA TAGGCTTAGGGCCAAATCAACAACTCTACTCTGGTTGCATGCTCATTTTTCTGGATAGACCCAACATAATTATTGGTTTGTTTTTGTCTTTCTTTTTTTAATAATTTGTATAATTCTCAT CTGCCGGTTCTCTTTTATGCAGGTGGTATGTCGAGTATGATTGGCCTTCCTTCAGATCACGCTCTTGTTGAGGATGATGAATGCTTAAGAGGTTCTTTATCTCTTTCTCTTATGCTACTC TTGATATGAAATTGGCCCCCACTTTTTTTATTTATTGGCTAAGCTAGCACTAAAATTTTAGTACAAAAGTGGTAAATCCTTTAAATAATTTGAAGTTATCTGAACAGATAAAACAATTAA AATACGAAGCATATCGTTTTCTTATTTTTCAGAATTCTATAAAATAACAGGTAACGCAAATAATCCATCAATTGGAAACAAGTAACAACTGCATATCGATTGGTAATGAATAAGTTATGT TCGTTAGATTTGTCTGACACTATCATTTGTGATTCAACGTGTCTTGCCATAGTAAACCATGTCCTTGTTTCTGGAGTACTAGCTTACACTTTACACACAATAGTGAAACATCAATTTTTA AACATTTAGGTCATGATCCTGAGCCTAACGCGTGCTCCTGTTCAAATGCTTGTATTATAGTTGTTTGTTGGTCTGAGGACTCATTTTGATTCTTTTTGTCCATGTAAGCAAACAATGACG TGCTGAAAAGAATATTGTCTTTTTAAGTAAACTTGAGTCAGTATTGTCTATCAAAAACTCCCATCAATCATGTACTTTAGGAGGGGAAAAATTTAACAAAACTTTTTAGCTGGACCATTG TATTATATCTTATTGATGTCTAAAAATTCAATTGCATGTTACATATCCCGGTGCACCGCATGTGCATGTTTCTGCTAATTATATGTTCCTTGGTGTGCATAACTTAAGAGAGTTCCATTG ATTGAACAGATGGATTAAAAAATACGCAGACAGTGAGAATCTGTTCTTTGAAGATTTCAAAAATGCGTATGTCAAGCTGGTGAATTCTGGTGTGGGTGGAATAGCTTATAAATTCAGGAG T |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
AGGCCAGGTACAAAGGAATATCTTCTCATTAAAGAAGAGGTGAGGAAGGTCTTGTCAAAGGGAAAGGCTGCTGGCGTGCTTCGATTGGTTTTCCTCGATGCCGGAACCTTTGACATCGAT GACAGTACAGGTATAATACTTTTAGTTCTGCAACAAGCAAAGACTCAGATAGATGTTATCCAACCAAATATTCTTCTATCTGTATCTTGGGCGGACATGAATATTGCTGTGGCTGGAGCT GAAGCAGTTGAAGTATGTGGAGGTCCACCTATCCAAGTTTCACCGGGTAGATTAGATACATTGGTGCATGATCCAGAAGGGAGACTTCCTGAGGAATCTCTCAATGCTTCTGGTTTGAAG AAATGTTTCCAGAGCAAAGGCTTTTTAACACAAGAACTTGTGGCTTTGTCTGGAGCCCACACTATTGGAAGTAAAGGTTTTGGAAGCTCAATTTCTTTTGAAAATTCATATTATAAGGTT CTTTTGGAGAAGCCCTGGACGTCTTCAGGTGGTATGTCGAGTATGATTGGCCTTCCTTCAGATCACGCTCTTGTTGAGGATGATGAATGCTTAAGATGGATTAAAAAATACGCAGACAGT GAGAATCTGTTCTTTGAAGATTTCAAAAATGCGTATGTCAAGCTGGTGAATTCTGGTGTGGGTGGAATAGCTTATAAATTCAGGAGT |
Retrieve as FASTA
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