Entry information : CvarAPx-R
| Entry ID | 8356 |
|---|---|
| Creation | 2011-05-02 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-07-27 (Catherine Mathe) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-05-27 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: CvarAPx-R
| Name | CvarAPx-R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase related [Orthogroup: APx-R001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Chlorophyta Trebouxiophyceae Chlorellaceae Chlorella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Chlorella variabilis (C.sp. NC64A) [TaxId: 554065 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8356' 'complement(join(77829..77971,78156..78264,78445..78591,78787..78913,79051..79181,79315..79710))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references CvarAPx-R
| Literature | Blanc,G., Duncan,G., Agarkova,I., Borodovsky,M., Gurnon,J., Kuo,A. Lindquist,E., Lucas,S., Pangilinan,J., Polle,J., Salamov,A., Terry,A., Yamada,T., Dunigan,D.D., Grigoriev,I.V., Claverie,J.M. and Van Etten,J.L. The Chlorella variabilis NC64A Genome Reveals Adaptation to Photosymbiosis, Coevolution with Viruses, and Cryptic Sex Plant Cell 22 (9), 2943-2955 (2010). |
|---|---|
| DNA ref. | GenBank: GL433872.1 (79710..77829) JGI genome: scaffold_38 (68402..70897) |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 56419 |
Protein sequence: CvarAPx-R
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (5 introns). N-term uncertain... | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
